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测序一个方向成功一个不成功
PCR
测序一个方向
双峰一个方向无信号是为什么
答:
能跑毛细管候跑能本两条同序列
DNA
测序
为什么会失败
答:
二是引物的原因
,测序的引物除了通用引物就是PCR 的特异引物了。测不出时考虑更换新的引物或者改换另一个方向来测。(注意:即使是同一个模板,正反引物测序的效果可能相差巨大)。虽然很多时候使用PCR 扩增引物来做测序引物,但是测序对引物的特异性要求很高。如果引物与模板的非特异退火,延伸会导致“套...
克隆某个基因的cds序列,大小对,但
测序不
对怎么回事
答:
克隆出来基因序列并
测序
之后,通常先要鉴定这个序列是不是符合我们要求的,通常用生物信息学的方法,去ncbi做
一个
blastx,通过比对结果来判断这个序列是什么基因,此外,blastx结果会给出比对的
方向
,很容易就可以判定你测序的那条序列是正向的还是反向的,如果是反向的,那么就需要把它进行互补翻转,就得到了编码...
测序
结果单向无法拼接是什么意思,急求解答
答:
如果是高通量
测序
,分为single-end reads测序和pair-end测序;然后,要看你用什么软件拼接,单向测序理论上也是可以拼接的,也有软件可以做到,但是拼接的结果非常不好,既然拼接当然是想要实际拼接结果,所以没有用单向拼接的。。。
核酸序列
测序
回来的结果中正向序列与反向序列是怎么样的一种结果啊?
答:
反向互补的。比如一条序列如下:-ATCGATCG- -TAGCTAGC-
测序
回来的结果就是:正向测序结果:ATCGATCG 反向测序结果:CGATCGAT
平末端链接,
测序
后,顺序经常是反的,怎么避免?
答:
这个平末端链接,正反都能有,这个不能避免的,但是可以在
测序
判断反正。PCR扩增,一端采用载体上的通用引物,另一端采用目的基因上结合的引物,PCR之后根据条带大小就可以看出来了。
技能——如何判断
测序
数据是否是链特异性
答:
利用 RseQC 进行判断,其python小脚本 infer_experiment.py 可以帮助我们判断链特异性
测序
。安装完成后发现,其实并没有安装软件,而是多了一些脚本,其中
有一个
就叫 infer_experiment.py 。部分参数: (1) -i 比对生成的bam文件(可以不用排序) (2) -r gtf转bed12文件产生...
什么是双向DNA
测序
答:
DNA是由正反两个走向的核苷酸链互补而成,一般情况下,可以采用针对其中一条链的引物(短片段核苷酸)进行核苷酸序列测定,就可以推断出另一条核苷酸序列,这就是单向
测序
;有些时候,必须要采用不同的引物,分别从两
个方向
对两条核苷酸链都进行测序,就是双向测序。
测序
结果怎么分析
答:
1.寻找引物 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对,去除引物序列,找到目的片段。在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(
一个不
变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,...
什么是反向
测序
答:
反向
测序
:就是用下游引物做测序引物往上测序。正向测序:就是用上游引物做测序引物往下测序。双向:就是正反两头同时测 测通:就是得到全场序列。一般超过1600bp的需要设计中间引物才可以测通。
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测序正向成功反向失败
双向测序只有一向能测出来
测序双向和测通的区别
双向测序一端重叠峰一端正常
测序重叠峰结果能用吗
双向测序是各测一半吗
测序结果不对怎么办
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测序结果有几个碱基对不上