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PDB数据库
“
PDB
”代表什么?
答:
PDB
,即"Parallel DataBase"的缩写,其中文解释为“并行
数据库
”。这个术语在计算机科学中被广泛使用,尤其在数据库系统的设计和实现中占据重要地位。PDB的英文单词直译为“并行数据库系统”,其拼音为“bìng xíng shù jù kù”,在计算机领域的缩写词中,其流行度达到了1080,主要应用于计算和驱动程序...
蛋白质
数据库
有哪些
答:
1.
PDB
蛋白质
数据库
PDB(Protein Data Bank)是全世界最大的蛋白质结构数据库。它包含了大量的蛋白质三维结构信息,这些结构信息是基于X射线晶体学和核磁共振等实验手段得到的。科研人员可以通过该数据库查询蛋白质的结构、功能以及其他相关信息。2. UniProt蛋白质数据库 UniProt是一个综合性蛋白质数据库...
分子对接系列---
PDB数据库
(选择合适的蛋白受体)
答:
欢迎来到分子对接探索的奇妙世界,首先,让我们深入理解
PDB数据库
——这个生物大分子结构的宝藏库!由美国Brookhaven国家实验室在1971年创立,由RCSB精心维护的PDB(Protein Data Bank),是全球生物分子结构研究的核心平台,它收纳了无数蛋白质、核酸和糖类的三维结构,这些都是科学家们通过X射线单晶衍射、核...
数据库
攻略 | 一文了解蛋白质分类、蛋白质结构、功能和相互作用分析的数...
答:
而当涉及到蛋白质结构的预测时,
PDB
:三维结构的宝库</起着关键作用。PDB是蛋白质结构的权威
数据库
,它收纳了超过170,000个结构,涵盖蛋白质、核酸、小分子和复合物。研究人员可以利用PDB进行实时的结构预测,探寻蛋白质的内在结构与功能关联,甚至为药物设计提供潜在靶点。最后,对于揭示蛋白质间的相互作用...
地质
PDB
是什么意思?
答:
地质
PDB
指的是“地球化学样品
数据库
”(PetDB),是一个旨在收集和提供全球海洋、陆地和大气中地球化学和地质学数据的开放访问数据库。这个数据库是由美国国家科学基金会资助的,旨在为全球地球科学家们提供一个强大的工具,以促进海洋和陆地地球化学领域的研究和探索。地质PDB包含了全球多个地质时期和多种不...
oracle
pdb数据库
怎么打开
答:
打开
PDB数据库
的方法有两种:方式1:SQL> alter pluggable database PDBEPPS open;Pluggable database altered.SQL> select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs;CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE --- --- --- --- --- 2 4071321146 E89E8DA2866E3157E043DE07A8...
PDB数据库
简介
答:
PDB数据库
的维护由结构生物信息学研究合作组织(ResearchCollaborationforStructuralBioinformatics,RCSB)负责。1、数据来源主要通过实验(X射线晶体衍射,核磁共振,电子显微镜方法等)测定的生物大分子的三维结构。主要是蛋白质的三维结构,还包括核酸、糖类、蛋白质与核酸复合物的三维结构。信息原子的空间坐标、引用...
以下关于
PDB数据库
描述正确的是:
答:
E.
PDB数据库
是二级蛋白质数据库 F.PDB数据库只储存蛋白质分子的3D结构 G.PDB数据库里既包含实验方法解析的大分子3D结构,也包含计算机预测结构模型 H、X射线衍射法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库 正确答案:PDB数据库是一级蛋白质数据库;PDB数据库存储大分子的3D结构;PDB数据库里既包含蛋白...
pdb
的
数据
答:
PDB
是由世界蛋白质
数据库
(Worldwide Protein Data Bank,wwPDB)管理。PDB是结构生物学的关键性资源,大部分学术刊物,以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院(NIH)],现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB。 从PDB的网站上,可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构,并可以将...
. 查到的 ACE 晶体数据在
PDB 数据库
中的 ID 编号是多少
答:
PDB数据库
存储结构数据的文件是PDB文件,每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号,即PDBID, 文件的扩展名为.pdb。PDB文件可以由各种3D结构显示软件打开,比如pymol,Swiss-PDB viewer,VMD等。PDB文件里面的信息是有严格的格式的。各行数据,如标识,原子名,原子序号,残基名称,残基序号等,不仅要按照严格的...
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