33问答网
所有问题
当前搜索:
ncbi序列比对看的是什么
克隆后测序后
序列
问题
答:
挑出几个菌落直接培养测序是不适当的。菌落中有很大一部分比例转进去的是空载体,没有成功连入目的基因片段。所以要多挑一些单菌落,培养后用菌液PCR或者提质粒后双酶切鉴定是否连入目的基因,选择成功连入目的基因(阳性克隆)的再拿去测序。你现在的测序结果,很有可能只是载体本身的
序列
。
想请教一下做RACE时,特异性引物的设计问题,以及如何根据同源保守区设计...
答:
选择核苷酸
序列的
保守区设计引物,其一是为了防止PCR扩增时由于序列变异而导致的PCR假阴性;其二,用一对引物就可以应用于不同菌(毒)株(物种、区域)来源样品中某一特定核酸序列的PCR鉴定。建议你先做3‘race,这个比5’race简单很多,你
在NCBI上
查找植物基因的序列,然后设计3‘race的接头引物,以及...
怎样能将DNA
序列
从反向换算成正向?
答:
你说的是反向互补还是直接反向?可以用primer或者DNASTAR.那就反向互补一下看。
...测序结果BLAST只有引物和部分
序列
正确,其他
什么
都不是,紧急求助_百 ...
答:
解释不通,做得量多的话,可能是测序
序列
与目的片段不匹配。查看下blast软件是否用对。最麻烦的是引物设计出现问题
有了16SrDNA的
序列
,构建系统发育树要怎么做啊?
答:
我的建议是,16S rDNA的分类技术在菌种鉴定方面的研究比较成熟,可以省去形态鉴定。具体在细菌定种方面,如果你的实验样本不是太多(应该不会超过100个吧?),你可以拿个体
序列
直接去
ncbi的
blast上进行
比对
,选择近似度最高的菌种序列进行定种,不一定非要构建进化树才可以。分子进化树只是在直观上为分类...
已知引物对如何
在NCBI
中找目的基因名字
答:
然后注意Primer Pair Specificity Checking Parameters里面的database,看看你的
序列
是mRNA 还是RNA 还是基因组,下面的organism也得看看
是什么
生物 然后直接get primers应该没问题,里面参数都设计好了的 target基因的名字 长度 基因注释什么的都在出来的后面 Tm值得看你的引物 ...
什么是Genbank,它的主要用途
是什么
?
答:
· STSs -
序列
标签位点。短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。· 注:SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到
NCBI
数据库的单核苷酸多态性库中(dbSNP)。国际核苷酸序列数据库合作组织 · GenBank,DDBJ,EMBL - 合作计划的概述,并链接到相应的主页。GenBank,DDBJ(DNA...
有没有输入碱基能预测蛋白质三级结构的软件或网站
答:
http://swissmodel.expasy.org/ 这个是最经典的 但是你要先翻译成氨基酸
序列
不知道你是想要基于
什么
技术的预测方法
请各位大侠预测一下这个蛋白
序列的
保守功能域并确定是哪个基因的编码产...
答:
保守功能域(conserved domains)IPR013149: Alcohol dehydrogenase, zinc-binding, Domain PF00107: 162 - 304 ADH_zinc_N IPR013154: Alcohol dehydrogenase GroES-like, Domain PF08240: 30 - 116 ADH_N 根据这个预测结果和blast的结果(swissprot database)这个蛋白至少是Zinc-binding alcohol ...
PCR不能扩增出目的条带,用
的是
文献中提供的引物
答:
建议:1、用引物
在ncbi
里去查,看看是否完全匹配,国外文献尚有错误,如果是国内的...;2、不是提高退火温度,而是降低,看看是否有非特异性的产物;3、有条件的话,建议找一个阳性对照,质粒最方便。如果没有这个基因的,可以找一个看家基因的,再合成一对引物,做阳性对照。检查整个体系中是否有问题...
棣栭〉
<涓婁竴椤
15
16
17
18
19
20
21
22
23
76
其他人还搜