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测序结果与已知序列比对
STEP4: 得到表达矩阵的流程
答:
FastQC的检测报告左侧会给出
测序
质量的一个summary,通常并不是所有的检测项都会是绿色通过,会有一些警告和fail的项目。主要可以从Per base sequence quality 看一下测序碱基质量,Per sequence GC content 看一下GC含量,如果实际的GC含量(红线)出现双峰,且导致后期的
序列比对
很低时,需要引起注意,有...
生物学分支学科特点? 互联网上生物学信息资源类型和特点?生物学信息数 ...
答:
4、常见的DNA
测序
方法有哪些?各有何技术特点和优缺点?Maxam-Gilbert DNA化学降解法:优点:可测完全未知
序列
及CG富含区;缺点:操 作繁琐;Sanger双脱氧链终止法:优点:简便,可测较长片段;缺点:需
已知
部分序列或 加接头;焦磷酸测序:优点:廉价、高通量;缺点:一次测序片段短。5、分子生物学数据...
银河证券:基因
测序
如何催动精准医疗迅猛发展
答:
基因
测序
是通过采集血液、体液或细胞,使用测序仪器获取被检测者的DNA
序列
,然后利用生物信息学方法将该基因信息
与已知
的基因突变数据库进行
比对
,并分析其中的异常突变信息,进而诊断疾病,甚至用于患病风险的预测。人体基因组测序内容主要包括靶向重测序、外显子测序、转录组测序和全基因组测序。通过与正常序列的比对,发现...
扬子鳄的相关资料
答:
3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心.利用一对简并引物对MHC Ⅱ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、
测序
,并将测得序列与下载的8个物种MHC
序列比对
,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4.0构建MP树.
结果
得到10种不同的序列,片段长166bp.核苷酸序列中有38个...
用 生物信息学软件 解决 一个生物学问题
答:
必要时对比
结果
是可以被编辑的,并且如果数据库条目有相似的特征,这些特征可被附加给用户
序列
。 (3)用查询序列搜索数据库,将找到的条目与查询序列进行对比并产生进化系统树 克隆并
测序
一个未知功能基因的用户可能希望在一个数据库中搜索相似的序列。如果搜索到了,用户可能进一步希望创建与查询序列最相似的序列的多序列...
生物信息学的实际应用有什么?
答:
通过生物信息学方法对这些数据进行处理和分析,我们可以更好地理解基因组的结构和功能。基因预测基因预测是判断基因组序列中的开放阅读框(ORF)是否为真正的基因,以及确定基因的位置和组成结构的过程。生物信息学中常用的方法有基于
序列比对
的同源性预测和基于统计学模型的非同源性预测等。这些方法可以帮助...
生物信息学研究的内容
答:
6、分子进化和比较基因组学,是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因
序列
的异同来研究生物的进化,构建进化树。既可以用DNA序列也可以用其编码的氨基酸序列来做,甚至于可通过相关蛋白质的结构
比对
来研究分子进化。以上研究已经积累了大量的工作。近年来由于较多模式生物基因组
测序
任务...
什么是Genbank,它的主要用途是什么?
答:
数据纪录的格式和搜索方式可能会不一样,但是accession number,
序列
数据和注解都是一模一样的。即,你可以用accession number U12345在GenBank,DDBJ或EMBL中查找相应纪录,得到的
结果
是完全一样的序列数据,参考内容等等。· DDBJ/EMBJ/GenBank 特性表 - 特性表格式和标准被合作数据库用在序列记录的注释...
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