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蛋白序列怎么测
2019-11-12 听课笔记之
蛋白质
组学研究方法概述(上)
答:
基本思路是,先用蛋白酶把
蛋白序列
进行酶切,再针对酶切后的肽段进行鉴定,所以进入质谱的检测对象永远是肽段,再根据肽段序列再推导出蛋白序列。 基于质谱的蛋白质研究常用方法 接下来我们就详细说说Bottom-up/shotgun方法,是
怎么样
用质谱对蛋白质进行定性检测的。这事儿分三步走不完,得分七步走: 1. 样本处理:...
知道一条
蛋白质
的氨基酸
序列
,该
如何
了解它的三维结构是否已知呢?_百度...
答:
查一下,看看这是神马
蛋白
,再查是否有人已经发表过这种蛋白的三维结构。可以用NCBI查一下(我记得可以用那个Blast功能,比对蛋白),再在PubMed里面查一下有关该蛋白的消息,看看有没有关于三维结构的文章发表~
给定dna
序列
编码多种
蛋白质
的三种方式?
答:
1从第一个字母开始,每三个字母一组,查课本上的表,得到一组
蛋白质
的
序列
2从第二个字母开始,每三个字母一组,查课本上的表,得到一组蛋白质的序列 3从第三个字母开始,每三个字母一组,查课本上的表,得到一组蛋白质的序列
如何
分析某个
蛋白质序列
属于哪个通路
答:
蛋白质序列
测定技术先于DNA序列测定技术问世,蛋白质序列的搜集也早于DNA序列。蛋白质序列数据库的雏形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初,美国国家生物医学研究基金会(National Biomedical Research Foundation,简称NBRF)Dayhoff领导的研究组将搜集到的蛋白质序列和结构信息以“蛋白质序列和结构地图集”...
关于
蛋白质序列
的问题
答:
蛋白质
中基本氨基酸只有二十种。若有其他氨基酸,也都是二十种基本氨基酸经过修饰得来的。不知楼主学过生化吗?氨基酸基本结构是一样的,区别只在于R基。就是说,二十种基本氨基酸只意味着二十种R基。
序列
中的数字就代表残基的顺序,每行60个残基,从第一个到第60个。一行肽链有三个氨基酸,残基也只有三...
如何
推定一条新鉴定的
蛋白质序列
的生物学功能?
答:
1,通过blast寻找其同源
蛋白
,如果有,再根据其同源蛋白的功能推测其功能,并实验检测。2,如果没同源蛋白,那就麻烦了。建议先通过融合GFP确定该蛋白的亚细胞地位,上调、下调该蛋白,观察一些指标。
知道了一个
蛋白
的氨基酸
序列
通过那个软件或者是在线网址预测它是否是糖...
答:
NCBI,就是专门
测蛋白质
的,可是就是全英文的,上边也有相关软件下载的。
在NCBI上查一个基因的mRNA和
蛋白质序列
,
怎么
知道这个基因是含有信号肽的...
答:
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析 比如:http://psort.ims.u-tokyo.ac.jp/ http://www.cbs.dtu.dk/services/
用
蛋白序列
可以检测基因完整性么
答:
不可以啊,如果是不表达的区域就没办法知道了。
如何
预测一个新基因编码
蛋白
的氨基酸
序列
答:
如何
预测一段多肽链的氨基酸
序列
有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰
蛋白质
。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质...
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