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blast比对结果不一致说明什么
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第1个回答 2022-01-04
你在用DNAMAN的多序列比对时，在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧？包括编码链和非编码连的比对，你测序得到的目的片段可能是非编码链（即你目的基因的编码链的互补序列），而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。
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blast结果
如何分析
答：
Blast比对结果
中，Score得分值越高
说明
同源性越好；Expect期望值越小比对结果越好，说明因某些原因而引起的误差越小；Identities是同源性（相似性），例中所示比对的1588个碱基中只有3个不配，其他99％相同，同源性相当好几乎是一样的；Gaps是指多出或少的碱基或缺失的碱基数；Strand＝plus/plus指两条序...
文献引物
blast
对不上
答：
1、BLAST参数设置不正确：在这种情况下
，您可能需要调整BLAST参数，例如比对阈值，匹配长度等。2、引物为含有同源臂的重组引物：这类引物包含有目的基因序列和载体序列的部分，使得在数据库中无法检索到这类复合的序列，可以逐步减少复制的序列长度进行BLAST。3、NCBI数据库中没有目标基因的序列：这种可能性...
如何看懂NCBI
BLAST
输出
结果
答：
解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表
比对
上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分，如果序列匹配上得分，不一样，减分，分值越高，两个序列相似性越高 E Value 值越小，越可信，相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度 Identities
一致
性，就是两个序列有多少是一样的...
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