1. 办公室: 负责日常政务管理，包括文件起草和审核，组织会议，秘书事务，以及文电处理、信息综合、文书档案、工作督察等。还负责办公自动化、信访、保密、税收宣传和内部工作规则的制定。
2. 人事处: 管理全市地税系统人事，包括干部人事、劳动工资、机构编制等，负责领导班子建设和后备干部队伍建设，机关及直属部门的人事管理，以及公务员培训和出国（境）人员的审批。同时负责老干部服务和管理工作。
3. 基层工作处: 负责思想政治工作和精神文明建设，负责干部学历教育和教育培训，以及先进集体和个人评选和基层建设。
4. 计划财务处: 执行税收计划和会计统计制度，预测税源，编制和管理税收收入计划，组织税款入库，负责票证管理和经费、财务监督。其下设“数据分析处理中心”，负责征管数据处理。
5. 征收管理处: 实施税收征管法规，管理税务登记、纳税申报等，指导个体、私营和零散税收征管，审核缓缴税款和呆账核销等工作。
6. 税政一处: 负责营业税、土地增值税等税政业务，制定征收管理办法，组织税收工作。
7. 税政二处: 负责企业所得税和个人所得税等业务，以及私营企业财务检查，指导相关税收工作。
8. 税政三处: 负责国务院和省政府指定基金和费的征收管理。
9. 政策法规处: 调查税收法制工作，参与法规起草，制定规范性文件，负责执法监督和重大税务案件审理。
10. 信息管理处: 制定税收信息工作规划，管理信息资源，提供技术支持，参与征管软件开发和系统网络建设。
11. 监察室: 负责廉政教育、行风建设和违纪案件查处，处理来信来访。
12. 后勤服务中心: 负责机关后勤事务，包括固定资产、物业、食堂、车辆管理等。
13. 机关党委: 负责党群工作和党员管理。
14. 工会: 负责工会工作和管理工作。
15. 团工委: 负责团员青年组织和思想政治教育。
16. 纳税服务中心: 综合负责全市纳税服务工作，指导各地税系统的纳税服务。