南和县粮食局设有多个职能机构，各司其职，确保粮食工作的有效进行。首先，办公室承担着重要职责，负责组织各类会议，草拟各类文件，并处理文件的收发工作。在政工人事、党务、信访、计划生育、机关后勤以及机关规章制度的执行监督等方面，办公室也发挥着不可或缺的作用。
其次，财审股是负责财务和审计的核心部门。他们负责全县国有粮食企业的商品粮油、政策性粮油以及储备粮油的购、销、存会计核算。同时，财审股对企业的费用列支、经营资金使用以及国有资产的保值增值进行严格的监督管理。系统内的审计管理和内审制度的完善，也是由他们来推动和执行的。
最后，监督检查股承担着对粮食市场的监督职责。他们对粮食经营者的购销存活动、粮食流通制度的执行、粮食收购许可证的管理进行严格的检查。此外，他们还负责全县全社会粮食收支平衡的调查统计工作，确保粮食市场的稳定和健康发展。