菌种16sRDNA测序,NCBI比对结果怎么分析

如题所述

第1个回答  2017-02-18
第一:打开Bioedit软件,导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列
File New Alignment Sequence New Sequence 导入拼接好的样品序列和标准参考序列(从TEXT文档利用复制粘贴工具) Apply and close 保存结果 关闭窗口  
第二:点击菜单栏上按钮 Accessory Application ,选择 Clustalw Multiple Alignment 
File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment 
第三:比对结束后,删除比对序列两端的多余序列,使所有序列等长 
选择需要编辑的序列 Sequence Edit Sequence 进行序列的编辑 保存修改后结果  
第四:选择 Sequence 菜单下的 Gaps ,点击 Lock Gaps  
第五:将比对后的序列保存为Fasta 格式文档本回答被网友采纳