在遗传学中，X连锁隐性遗传（XR）指的是那些与性状或遗传病相关的基因位于X染色体上，且这些基因为隐性，随X染色体的遗传模式传递。在隐性遗传情况下，女性由于拥有两条X染色体，只要其中一条携带有显性基因，就能掩盖隐性基因的影响，表现出正常。只有当两条X染色体都是隐性基因（XaXa）时，才会显示出相关性状或疾病。男性则不同，只有一条X染色体（XaY），只要X染色体上有隐性基因，就会发病，因为他们的Y染色体上没有对应的等位基因，被称为半合子（hemizygote）。
以红绿色盲为例，这是一种常见的X连锁隐性遗传病，致病基因位于Xq28。男性患者（XbY）与正常辨色能力女性（XBXB）结婚，女儿（XBXb）会成为携带者，儿子（XBY）则正常。女性携带者与正常男性结婚，子代中儿子有50%正常，50%患病，女儿中则有50%携带者，50%正常。这种遗传模式显示出“父传女，母传子”的交叉遗传特性，女性患者的父亲必然是患者，母亲则是携带者。
从红绿色盲的系谱中，X连锁隐性遗传的特点明显：男性患者相对较多，且往往来自携带者母亲；男性的兄弟、表兄弟、外甥等亲属中常见患者，而外祖父发病较少；男性患者的子女通常正常，导致代际间出现明显的不连续性（隔代遗传）。
所谓隐性遗传是指父母携带某种基因但不发病，其基因遗传给后代后则使其发病。常染色体隐性遗传性多囊肾就是如此，其上代携带此基因，但终生没有多囊肾的表现，其子代通过遗传而获得此种基因后则发病，且在初生及婴儿期（有些甚至是胎儿时期）即表现出很严重的症状。