主要区别是，文化不同、舒适不同、卫生不同，具体如下：
一、文化不同
1、穿睡衣睡觉
睡衣也有睡衣文化，穿睡衣睡觉不仅体现出一种舒适、健康，同时也体现一种文明。
2、不脱衣服睡觉
不脱衣服睡觉是一种不健康，不高雅，不文明的行为。
二、舒适不同
1、穿睡衣睡觉
睡衣质地柔和，穿着舒适，既利于入眠，又利于熟睡。
2、不脱衣服睡觉
平时穿的衣服从材质和做工方面都是考虑到美观和出行方便，用来穿着睡觉不舒服。
三、卫生不同
1、穿睡衣睡觉
睡衣只用来睡觉，可以解决交叉感染问题。
2、不脱衣服睡觉
人们在工作、生活、学习的交往中，必然带有病菌。