环境与生态系成立于2007年2月，由原水域环境和水域生态学两个教研室合并而成。原水域环境和水域生态学都是伴随着我校的主干学科水产养殖而产生并发展起来的，并且均为我校水产养殖国家重点学科的发展作出了重要贡献。特别是当前随着我国水域生态环境的日益恶化和对环境保护要求的不断提高，为本学科的发展提供了广阔的前景。校院各级领导都非常重视本学科的建设。通过近几年的建设，本学科已建立了仪器设备完备、人员构成稳定的教学、科研体系。现有教师9名，教授2名，副教授5名，讲师2名，其中6名教师具有博士学位。硕士生导师3名。建有两个研究平台，即水域生态环境上海市高校工程研究中心和农业部水产动物营养与环境研究中心。 1、委托管理的专业
环境科学学士学位、园艺园林学士学位、环境科学硕士学位。
2、承担的主要课程
本科：养殖水化学、环境化学、生态学基础、环境工程学、环境监测、环境评价、水域生态工程与技术、水域生态学、景观设计初步、景观学概论、景观资源学、湿地生态工程、景观生态学、滨海景观生态工程、生态旅游、滨水自然景观设计理论与实践、园林工程概预算与经济分析、园林规划设计、园艺通论、环境毒理学、环境科学概论、现代环境监测技术、人居环境学、产品环境行为、环境教育学、环境与生物技术、景观与文化、行为生态学、城市生态学等。
硕士：水环境化学、污水治理、水域生态学、环境生态学等。
博士：高级水产养殖学、水产养殖生态学（参讲）。
3、承担的实习任务
环境监测与评价、水环境化学、生态学、水域生态景观评价、水污染控制规划、水域生态学、环境工程、水域生态景观规划与设计。 1、环境与生态系
系主任：刘其根教授
系副主任：张饮江副教授、李娟英副教授
2、环境科学教研室
正副主任：江敏教授（兼）、李娟英副教授
成员：彭自然讲师、凌云讲师
3、水域生态学教研室
正副主任：刘其根教授、张饮江副教授
成员：何文辉副教授、杨东方副教授、胡忠军副教授 本学科以水域环境或水域生态系统为主要研究对象，研究其中的各种生物地球化学过程及其对水域环境质量和对水域生态系统结构、功能及主要生态过程的影响、水环境质量的监测与评价，水域环境的污染控制和生物调控原理与技术以及退化水域生态系统的生物（态）修复等。学科着重于研究养殖水域中环境因子对生态系统的影响及其与养殖生产的相互关系、养殖水域环境调控原理与技术和富营养化水体的生态修复等。还涉及水域环境的养殖容量、渔业水域规划与水产养殖可持续发展等。主要的研究方向有：
1、水域环境监测（理化和生物）与质量评价。
2、水域环境毒理学和生态毒理学。
3、水生生物群落、水域生态系统结构与功能及其生态过程。
4、水域环境污染控制、生物调控原理与技术及退化水域生态系统的生态修复。
5、水域景观设计、规划和构建。
6、湖泊、水库渔业生态学和池塘养殖生态学
