一九四八年九月廿四日，济南市解放后，山东省立农学院（山东农业大学的前身）在十月初复学，设立农业化学系，这是现今资源与环境学院的起源。成立之初，条件艰苦，仅少数教师如孔跃卿、贾玉钧等支撑。至1952年，曹会漳等多位教师加入，教师队伍逐渐壮大，首届学生仅三十多人，毕业后大多投身中央及华东部的农业、地质等部门，成为早期的科技人才，如石华等人。
一九五六年，教育部认可我校农业化学系的优秀，将其改名为土壤与农业化学系（简称土化系），培养土肥专业人才，为全国土壤普查提供人员支持。期间，专业计划和目标不断调整，教研组数量及教师增至七十多人，土化系成为全校教师最多的系。一九六五年，土化系与植保系合并，但文革期间停止招生，直至一九七七年恢复。
文革结束后，土化系在教学科研上迎来了新的发展机遇。根据社会发展需求，调整教学计划，增设土地资源专业和硕士点，培养土地管理专业人才，与国家土地管理工作紧密结合。至九十年代，农业环保专业并入，进一步拓展了学科方向。这些举措培养出的一批专业人才，如今在土地管理领域发挥着关键作用，为全国和省的土地管理工作做出了贡献。
学院的前身是创建于1948年的农业化学系，是农业大学创建最早的院系之一。为适应资源环境科学的发展和社会经济的需求，于1994年10月撤系建院，成立资源与环境学院。在50多年的发展历程中，几代资环人艰苦创业，奋勇拼搏，励精图治，学科建设成效显著，办学水平不断提高，人才培养质量得到社会高度评价。