1936年12月，西陇海铁路正式由西安通车至宝鸡后，1937年即成立了宝鸡铁路医院（以下简称本院），隶属于交通部陇海区铁路管理局总务处卫生科领导。
建院初期的地址在宝鸡老车站第一站台中间花圃的西边大小房舍八间。同时，在龙泉巷（今群众路革新巷）租用国民党部队后勤部军需被服厂平房六间，占地三百平方米，作为养病所。当时，医院总共十一名工作人员，门诊开设以外科为主的综合科，养病所收治病人，全系外伤，设简易病床十二张。
1949年，中华人民共和国成立后，本院归属于郑州铁路局总务处卫生科领导。1951年3月19日，奉郑州局令，本院改为甲级卫生所建制。院址几经搬迁，最后迁至铁道西北端（即宝鸡车站卫生所所在地）。1858年5月7日，郑州铁路局批准本院又恢复医院建制。迁至宝鸡上马营，接收了铁道部第六工程局医院院址，直至今。
医院大事记：
1937年元月陇海铁路宝鸡医院（宝鸡市第二人民医院前身）成立，蒋德堃任院长。
1938年租用宝鸡龙泉国民党部队被服厂内房屋六间，建立养病所。
1947年元月建住院病房十五间，同时设立福临堡诊所，隶属于本院。
1949年7月14日宝鸡解放，本院接受军事管制，军事代表李大军。
1951年3月19日本院改为甲级卫生所建制，隶属于郑州铁路管理局卫生处领导。
1958年5月7日成立宝鸡医院，接受铁道部第六工程局马营医院院址；接管凤州卫生所；撤销宝鸡卫生所，改为宝鸡医院车站门诊部；接管略阳卫生所。
1963年中共宝鸡医院党总支成立。
1970年5月宝鸡铁路分局成立，本原隶属于西安铁路局卫生处和宝鸡分局生活卫生科领导。
1983年12月新建门诊楼2753m2。
1985年12月30日综合楼竣工。
1996年8月16日被陕西省卫生厅评为“二级甲等”医院。
1997年4月住院楼开工建设总计6445.8 m2。
1998年10月18日医院被评为陕西省卫生行业“创佳评差”最佳单位，是西安分局唯一获此殊荣的单位。
2000年3月29日新住院楼正式启用。
2003年5月14日医院共有80名医生、70名护士主动请缨上非典一线。
2004年12月31日宝鸡跌路医院正式移交宝鸡市卫生局。
2005年10月26日宝鸡市编发（2005）67号文件通知同意将西安铁路分局宝鸡医院更名为宝鸡市第二人民医院、差额事业性质单位，隶属于宝鸡市卫生局领导。
2007年8月13日宝鸡市政府办公室会议研究决定，将宝鸡市第二人民医院整体划拨为宝鸡职业技术学院管理。
2008年5月16日全院干部职工555人向5.12特大地震灾区捐款31260元。
2009年6月，医院一举通过了陕西省卫生厅组织的“二甲”复审。
2009年8月，门诊医技楼、住院楼工程正式开工建设。
2010年12月6日，门诊医技楼、住院楼工程按预定要求顺利封顶。
2010年4月17日，由罗琦、白洁、梁晓燕、苗振安、王新彬5名同志组成抗震救灾医疗队赴青海参加抗震救灾。
2010年7月25日，我院组织的医疗队参加了千河铁路桥抢险。
2011年6月，我院组织院领导和部分中层干部前往原天水铁路医院参观学习。
2011年11月全市行风打分评议，我院位居全市综合性二级甲等医院第11名。
