平邑县交通运输局承担着综合运输体系的规划协调任务，与相关部门共同编制综合运输体系规划，并指导交通运输枢纽的规划和管理。
在政策和规划方面，该局负责拟订全县公路、水路行业规划，执行上级部门的行业政策与标准，并监督其实施。同时，它参与制定现代物流业发展战略和政策，制定相关标准并监督执行，引导公路、水路行业改革工作。
在市场监管方面，平邑县交通运输局负责道路、水路运输的监督，确保执行国家和上级的运营规范、技术标准。城市客运管理、重点物资运输及紧急客货运输的组织协调也在其职责范围内。此外，水上交通安全监管是其重要职责，包括水上交通管制、救助打捞和危险品运输的管理。
在投资和资金安排上，该局负责提出公路、水路固定资产投资建议，执行相关规费政策，审核上报公路通行费收费等事项，并指导行业投融资工作。对农村公路和水路建设，负责市场监管和技术标准执行，协调重点工程和安全质量管理工作。
铁路建设方面，协助高速公路建设和地方铁路建设工作，负责国道、省道布局规划及农村公路建设、养护和管理。同时，负责与干线铁路建设和运营相关的协调服务。
在科技、环保和教育方面，平邑县交通运输局推动行业科技进步，关注环境保护和节能减排，指导行业教育和培训，并负责相关统计和信息发布。
对外交流和合作是其职责之一，同时指导交通运输领域的应急管理和国防动员工作。
最后，该局还负责完成县委、县政府交办的其他相关事项。
根据市委、市政府批准的《平邑县人民政府机构改革方案》（办字〔2009〕175号）和《中共平邑县委平邑县人民政府关于平邑县政府机构改革的实施意见》（平发〔2010〕32号），设立平邑县交通运输局，为县政府工作部门。根据职责，平邑县交通运输局设5个职能科室。