两者地位不同：
标准工时制是标准和基础，标准工时制是其它特殊工时制度的计算依据和参照标准。也即是说制定综合计算工时工作制要依据标准工时制来做参照。
两者工时制度不同：
1、标准工时制，是指法律规定的，关于在正常情况下，一般职工从事工作的时间的制度，标准工时制度，也称为标准工作制度，是由立法确定一昼夜中工作时间长度，一周中工作日天数，并要求各用人单位和一般职工普遍实行的基本工时制度。标准工时制是标准和基础，是其它特殊工时制度的计算依据和参照标准。
举例说明：
中国目前行政机关，事业单位普遍实行的是每日工作8小时、每周工作40小时。任何单位和个人都不得擅自延长职工的工作时间。这种是属于标准工时制。
2、综合计算工时工作制是指因工作性质特殊或受季节及自然条件限制，需在一段时间内连续作业，采取以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。
举例说明：
旅游公司导游带团出国旅游，不可能到了休息日就把游客扔在国外自己飞回国过周末，然后周一在飞到国外继续带团，只能连续工作，然后旅游公司招按相关制度给予调休，不调休的要支付加班费，类似这种情况需要实行综合计算工时制。
扩展资料
企业申请实行不定时或综合计算工时工作制申请需要材料介绍：
关于印发《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批管理办法》的通知
第五条 企业申请实行不定时或综合计算工时工作制，应当提交以下材料：
（一）企业实行不定时或综合计算工时工作制申请表（见附件一），写明岗位（工种）的职能、特点和申请理由。
（二）企业实行不定时或综合计算工时工作制的申请报告、实施方案、工时管理及工资支付规章制度。实施方案及规章制度需向本单位职工公示至少5个工作日，并提交公示反馈意见。
（三）企业申请实行不定时或综合计算工时工作制职工名册及职工签名表（见附件二）。
（四）企业法人营业执照副本及复印件。
（五）实行期满需再次申请的企业，应当书面报告上期实施情况。
（六）法律、法规或规章规定需要提交的其他材料。
参考资料：