清华大学医学部，成立于2001年10月25日，其诞生源于对生命科学和医学这一前沿领域的深刻认识。为了响应国家发展需求和全球教育科技趋势，清华大学设立医学院，这是其迈向世界顶级大学道路上的关键步骤。
学院依托清华大学综合学科优势，致力于培养全面发展的医学人才，他们需具备人文社科、自然科学、基础医学及临床医学的深厚理论基础，同时掌握临床技能和科学研究能力。目标是培养能在医学领域进行研究、医疗、教学及管理的多领域专家，学制为8年，优异毕业生将授予医学博士学位（M.D.）。
医学院充分利用清华大学的优质教育资源，构建了先进的基础与临床医学教学体系，借鉴国际先进教学模式，逐渐推进双语教学。为此，医学院积极招聘国内外知名医学人才，包括兼职教授和顾问，如301医院的专家，共同推动科研合作与教学进步。
为了实现2011年跻身国际一流大学的目标，清华大学医学部明确了在生命科学、纳米科学等领域寻求突破的战略。为此，学校于2004年成立了生命科学与医学研究院，整合全校相关学科，以推动跨学科研究，推动重大科研成果的产出。
医学部设有医学系、药学系、生物医学工程系等，以及第一附属医院（华信医院）和第二附属医院（玉泉医院），并提供丰富的本科生和研究生课程，涵盖了生物信息学、生物医学工程等多个前沿领域。学院的领导团队由院长吴阶平、常务副院长赵南明等组成，他们共同推动学院的行政与科研工作。
清华大学医学部前身清华大学医学院成立于 2001 年 10 月 25 日 ，首任院长由我国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。后与中国协和医科大学合作办学，，有时使用"北京协和医学院-清华大学医学部"的名称。