位于逢摩市奥山深处的一个的动物园，从车站搭乘公共汽车得花费两小时才能到达此处，该园长为椎名。这里早上9点开园，直到下午4点44分休园。园内的动物会因椎名的魔力而人类化。由于长期没有游客来到动物园参观的缘故，园里的动物粮食和经济情况逐渐拮据，让园里的动物和饲育员苍井华都伤透脑筋。而随着剧情发展，逐渐有外界人士察觉这座动物园的存在。
动物园的名字典故，取自下午4点44分的传说：太阳西下，天色渐暗，人与物难以辨别的时间带，被称作“与魔相遇”的时间。
【人类】
园长椎名（しいな）
漫画初登场：第1话逢魔之时动物园园长，头部是兔子，用围巾和帽子遮着脸。因为在很小的时候打猎遇见了兔子妖怪，然后被兔子妖怪诅咒变成兔子,拥有能让动物说话和自由地变成像人类一样的不可思议力量.目标是把逢魔之时动物园变成天下第一的动物园,解除诅咒变回人类,第七话中打完狮子的椎名一只手变回人类的手。
性格：有点单细胞，却一心只想做有趣的事。并且十分珍视自己动物园里的每一个同伴。认为自己如果没有能力保护自己的同伴就不配当园长的精神。“园长并不是为了利用自己的地位压迫成员而存在的，而是因为我是园长，我才最有义务保护大家”
苍井华（あおい はな）
漫画初登场：第1话
总是失败的迟钝女,因为看到动物园招收饲养员的广告所以去应聘,因此展开了在逢魔之时动物园的奇妙生活 ，拥有相关动物的丰富的知识，并且想把自己的知识实际应用于照顾动物中去。
在逢魔之时动物园所经历的一切事物即使她吃惊，也使她渐渐重新开始认识自己并珍视作为同伴的动物们，单细胞的园长对她的绝对信任让她感受到不一样的自己，虽然只是饲养员，但因为这样的改变着也对椎名深信不疑，勇敢的去拯救同伴。
【动物】
斯斯德（シシド）
狮子，性别为公，在华来应征的前一个月进来的新成员，人化姿态为拥有茂密蓬松的短发，眼神锐利，披着毛皮与尖骨饰品，双手附着绒毛与利爪，穿着轻便衣装与绒皮靴的尖牙少年。性格好战，认为自己才是园内的老大，擅长生死战，弱点是不擅水性。最初因为成年被驱逐出团体，要侵占其他族群并杀掉该族群的头领，但最后战败并身受重伤（左腋侧边还留着伤疤），被椎名远从非洲大草原带回来，变身后却异常凶暴不受控制，甚至伤害动物园里的动物，椎名为了保护动物们的安全，决定不再让他变身。第六话华在与蟒蛇的谈话中注意到自己已经来动物园一段时间，却还没见过狮子的变身，在好奇心的驱使下偷取了“魔力”，变成人型后的狮子再度暴走，企图以打倒椎名来证明自己才是老大，在平息下来后被重新接纳为动物园的伙伴。他的暴走事件，间接让椎名的左手变回人类的模样，但动物园也为了修复被他破坏的场地休园一天。
蛇女（ウワバミ）
蛇，性别为母，普通状态下是三条蛇，人化时的样貌和其他人化动物相比较接近人类，后方绑束的头发是蛇群，身穿露肩蛇鳞连身裙的性感美女，椎名与其他动物都用“蛇女”来称呼她。个性沉稳随和，当她笑的时候，头上的蛇会嘶嘶作响，会让头上的蛇将食物吞下，连她的泳装也是蛇鳞图样，一旦进入了狂暴状态，就连椎名与其他动物伙伴也会被她吓得哑口无言。由于本身拥有热能侦察的特性，因此透明化的隐藏对手在她面前也会无所遁形，而且很擅长躲在暗处进行侦察战斗。人化的状态下会解开发夹，让头发末梢的蛇群攻击对手。伪装成人类时，只需将头发末梢的蛇群包覆起来即可。被华尊称为“蛇姐”，对于华来到动物园协助照顾动物感到高兴。是加西的暗恋对象。仰慕椎名。
知多（ちた）
猎豹，性别为公，人化姿态是个头顶戴着眼镜，穿着斑点短裤的肥胖半人豹，是动物园内的大胃王。在华来担任饲养员之前总是在仓库里随意取食，加上吃饱又睡、睡饱又吃的性格导致体型肥胖，失去了擅跑这项野性。华为了让知多找回自己的野性，故意向椎名称知多对他有所不满，椎名听信了华的话，与知多展开一对一动物园赛跑，虽然知多在此赛败给椎名，却也成功的找回野性。后来椎名为了让它减肥，还在它的笼子内加装了跑步机。
加西（かさい）
印度犀牛，性别为公，人化时会从犀角生出脸孔和毛发，有着拉练般的牙齿，脸孔前端呈现犀角般的突起状，动物的躯壳则变成铠甲。性格害羞，平常总是沉默寡言，加上犀牛极差的视力（所以常会出现到处乱撞的毛病），让它跟园内的动物鲜少有互动，甚至常被误会很目中无人。擅长游泳，对蟒蛇有好感却很不主动。根据其他动物园伙伴的说法，直到蟒蛇发生溺水事件前，他们都没有听过加西亲自开口说话。由于华曾经告诉他“恋爱就是奋勇向前”，为了保护蟒蛇，就会一改平常温吞的性格，变得十分坚毅勇敢，就连丑时三刻水族馆的干部NO.5一角，也对他的精神与勇气表示敬佩。
大上（おおがみ）
豺，性别为公，人化姿态是个身着毛皮大衣，穿着深色背心与长裤，拥有独特发型的半人狼，性格胆小，最怕遇到的就是疼痛和恐怖，一但见比自己还强大的对手就会吓到腿软，却常靠战略帮助自己或同伴扭转劣势（曾提到“狼的计算力很高”），加上自身又拥有优秀的听觉和嗅觉，在水族馆一战中有相当活跃的表现。虽然建议椎名将动物园的经营、整洁方面看重一点，但常因为椎名的任性导致无功而返。由于在水族馆事件为了躲避干部NO.4德拉库的袭击，被削去了原本覆盖前额的头发。
猩猩金刚（ゴリラコング）
大猩猩，性别为公，华因为嫌名字太长而直称它为“猩猩刚”（ゴリコン），人化时除了能说话其他感觉似乎没什么特别的变化，过去曾因为太过笨拙而被赶出群体，在热带雨林迷路时被椎名收留，对椎名的怀有相当感激之心。在愤怒或兴奋的情况下，会捶胸表达自己的情绪。最初不善表达自己的感受，在华的帮助下鼓起勇气，大力晃动椎名珍藏的石像“我之像”表达自己笼子太小的不满，这举动使椎名毁掉了“我之像”，并让猩猩金刚用毁坏的残骸扩大自己的笼子，虽然猩猩金刚认为自己笨拙，但从用残骸瓦砾盖宫殿这点来看，华反而觉得它意外的能干。恢复普通型态时，只要一被打扰睡眠就会朝人丢粪便。
五十岚（イガラシ）
斑海豹，性别为公，人化时言行举止都会变的很绅士化，身上会出现如绅士服般的斑点，称华为“女士”。平时个性温和，但扯上鳕鱼相关的事就会变得很凶暴，而且吃鱼的时候一定要从头部开始吃，否则会被鱼鳃和鱼鳞噎到喉咙。由于身上的毛是顺着身体流线生长，若是抱他的时候稍有不慎，就会被其他人轻易的抱走。第一话中曾被强盗集团绑架未遂，第九话中又被“丑三时刻水族馆”的干部撒卡曼达抓走，被伙伴们吐嘈“有作为掳走角色的才能”。
高寻（タカヒロ）
白尾海雕，性别为公，人化时为头戴耳机，大型翅膀长在背上，双臂（爪）戴着手表，下半身变成人类的双脚，穿着长裤与靴子的半人鸟。非常尽忠职守，平时是椎名的空中坐骑，但有时还会负责将同伴们带往目的地的工作。
岐佐蔵（キサゾー）
非洲象，性别为公，人化时从嘴部出现眼睛，原本大象的头部变成颈部围领，一对象牙竖立在肩膀上，象鼻则是朝头部后方弯，似乎看不到他的脸。个性内向且缺乏自信，有点孩子气，过度热衷于游戏时会忽略四周的事物，力量很惊人。他的听力相当灵敏，可以透过声音判断熟人，因此即便是普通状态下，只要听到熟人的声音也会适时避开，不至于和人相撞。经常负责将椎名的座椅扛在肩上，担任椎名的轿夫。
波波（ポポ）
河马，性别为公，人化时下颚有两颗大牙，河马头部会变成手臂，由于河马会为了标记地盘，经常让自己的粪便飞出来，因此椎名也为波波这项特性感到头疼。认为华能够当饲育员是动物园的一大助力。在动物园的腕力比赛排行NO.2，仅次于椎名。
福本（フクモト）
雪鸮，性别为母，人化姿态为鸟嘴长在额头上的鸟型脸孔，头部后方长著羽毛与大型翅膀，双臂前段留着羽毛与鸟爪，身穿羽毛长裙的女性半人鸟。 为于逢摩市隔壁的牛三市，比逢魔时刻动物园还要有人气的水族馆，每年约有超过600万以上的入场人数，以虎鲸、海豚、海象、海獭与沙丁鱼的主打演出吸引游客，直到深夜两点才休馆。馆长为水族馆唯一的人类伊佐奈。伊佐奈会利用魔力将园里的海洋生物人化，也因为海洋生物的特质，就连干部会议也是在水里举行。然而因为伊佐奈的高压统治，使得其他的海洋生物生活在压力下而毫无生气，有的海洋生物甚至无法勘荷工作量，导致身心的健康状况恶化。经过水族馆战役后，伊佐奈离开了水族馆，由原本的干部NO.5一角接管水族馆的事务。但水族馆的动物表演水平与人气也变得不如以往，甚至开始长期休业，令原本的赞助商决定不再资助水族馆，而另外寻找投资的目标。
【人类】
伊佐奈（いさな）
漫画初登场：第11话水族馆的馆长，实力很强。和园长一样，都是拥有魔力的人类，但是却受着诅咒。拥有强大的魔力，能自由变换自己的形态。伊佐奈从小过着富家公子的生活，家族十分富有，在很小的时候独自包船在海上航游却只是因为想亲手尝试杀死鲸鱼的滋味。可令人吃惊的是巨大的抹香鲸自己跳出海面，在他对属下动手时发起了鲸鱼的诅咒，收到鲸鱼妖怪诅咒的他成为和椎名一样被某种神秘妖怪诅咒着的人类，同时也具备变身以及操控动物们变身的能力（似乎与椎名相似），之后他按照妖怪的指示建立水族馆。“把你变给我看，我要看见一个懂得全新的不一样的你之前将无法把你变回去”。漫画22话中与椎名战斗进入高潮时变成巨大的整只鲸鱼。破坏力惊人！
【动物】
撒卡曼达（サカマタ）
虎鲸，性别为公，丑三时刻水族馆的No.2。普通时候和海藏是表演秀中的动物明星。在水族馆内地位仅次于伊佐奈。人化时拥有四只眼睛（发怒或战斗时才会张开），水栖型的鲸鱼皮（脸部、背鳍、人形身驱除外）以一分为二的姿态，附在人形身躯上，性格冷静也相当绅士化，但如果是在被激怒或者遇到看不顺眼的人的情况下，就会展现出虎鲸的凶暴把对方吃掉。因上陆时间有限而经常携带着装有海水的保特瓶，并不时的将海水洒在头上，水中游泳时速高达60公里。水族馆最终战因为华的一句“这里根本只是牢笼”，让他醒悟到不该再受伊佐奈支配，并与动物园的成员们一同对抗伊佐奈。水族馆战役结束后带着只剩一口气的伊佐奈回到大海。
凯宙（カイゾウ）
海象，性别为公，丑三时刻水族馆的No.3。普通时候在表演秀中负责表演杂技。人化时脸上戴着防风镜般面罩的胡须老头，性格豪迈，普通人一但施展全力战斗就会被他用来支撑身体的大牙给重创。水族馆一战中对上猩猩金刚，起初以巨大的躯体、杂技中得到的战斗经验让自己不断得到优势，后因大上的使策而摔倒，被猩猩金刚强大的握力抓住脸部后昏倒。于水族馆战役后被一角救回会议室。
德拉库（ドーラク）
高脚蟹，性别为公，丑三时刻水族馆的No.4。普通时候是担任照明设备的工作人员。人化时带着螃壳面具，蟹脚长在背后，比起横向走路的螃蟹，他可以前后左右自由移动，性格自大，发言都十分损人，常妄想利用别人当垫脚石让自己晋升。水族馆一战中与铁火玛姬对上大上和知多，一度将胆小的大上逼入死胡同，最终因大上的计策而与铁火玛姬相撞败北。于水族馆战役后被一角救回会议室。
一角（イッカク）
一角鲸，性别为公，丑三时刻水族馆的No.5。普通时候担任水族馆的动物调教师。人化时是个穿着整齐注重礼仪端正的骑士，原本长在鼻子上的长牙，变成手持的牙剑，擅长西洋剑术，本人提到自身荣耀是“以此牙剑和骑士道精神”。当佛卡因为和撒卡曼达起争执被伊佐奈重伤濒死时，他是唯一对佛卡表示怜悯，并要求帮佛卡举办葬礼的干部。水族馆一战中与魔鬼鱼对上蟒蛇和加西，为了要加西说出自身荣耀而与它展开一对一决斗，最终被加西对蟒蛇的爱意、甚至不惜牺牲的精神所感动，亲手击败了章鱼让加西和蟒蛇逃走，更故意无视伊佐奈的“反响定位”通讯动身离去。水族馆战役结束后，正式接管水族馆的事务。
佛卡（フカ）
大白鲨，性别为公，丑三时刻水族馆的No.6。人化时会从嘴巴出现脸孔，从鱼鳍生出手爪，鱼尾变成人类的双脚，认为自己才是海中的支配者，对一直占著No.2位子的撒卡曼达相当不满，在干部会议中因为和撒卡曼达起争执，被馆长伊佐奈打成重伤后遗弃在垃圾场，遇见因为伊佐奈而被吹飞到垃圾场的椎名，透过伊佐奈的“反响定位” 通讯，得知五十岚将被带往馆长室，因为被利用完后抛弃的那份懊悔和悲惨，他希望椎名带着他的不甘向伊佐奈报仇，最后也祈求椎名将它送往出生的故乡大海，临死前几枚鲨鱼牙因此掉落在椎名的围巾上。后来的水族馆最终战，那些鲨鱼牙意外成为椎名逆转情势的关键。
铁火玛姬（鉄火マキ）
金枪鱼，性别为母，丑三时刻水族馆的No.7，是水族馆干部中唯一的雌性生物。普通时候是担任海豚表演秀的监视师。人化时是个头戴鲔鱼骨骸，留着桃红色短发的人鱼，由于她在不动的时候会出现窒息的情况，因此对于必须静止不动又时间垄长的干部会议完全无法忍受，讨厌痴肥的生物，在水中最高时速可达160km。水族馆一战中与德拉库对上大上和知多，意图将知多拖入水族箱，却被大上看出她虽然速度快却无法控制的缺点，大上因而使计让她去追知多，最终因为煞车不及冲破水族箱，与德拉库相撞败北。于水族馆战役后被一角救回会议室。
恶魔费旭（デビルフィッシュ）
章鱼，性别为公，丑三时刻水族馆的No.8。普通时候担任水族馆的动物调教师。人化时身体是人类、头部则是章鱼的头和八只脚，有口吃的毛病，性格傲慢。一角直接称他为“魔鬼”，拥有能够和周围环境同化、自切、麻痹敌人的唾液等真蛸拥有的特性。水族馆一战中与一角对上蟒蛇和加西，因为迷恋上蟒蛇，在打算将她抓走时被一角击败。于水族馆战役后被一角救回会议室。 于八月中下旬来到逢摩市，以动物表演为主轴的巡回马戏团，该马戏团的团长为道乃家。
【人类】
志乃万（シクマ）
“八时马戏团”的统治者，被棕熊妖怪诅咒而拥有熊的容貌，穿着背心，右手套著护腕，有着深沉黑眼圈，前方两束短辨缀著小铃当的长发男子，双眼、身体右半部（肩膀到手臂）、胸膛、腹部已经恢复成原来的样子。平时总是穿着道具服或变化为普通的熊来作伪装，但由于指头没有像一般熊是五根横著并列，因此很快就被了解动物的华给识破，讨厌下雨天，为了依靠动物设施提高声望，因此和八时马戏团结下契约，好让自己恢复人型的面貌。在椎名等人来到马戏团观赏表演时就闻到了他们身上的“野兽臭味”，并且将他们关入笼子里，还拒绝与动物园方合作的要求。
道乃家（ミチノケ）
“八时马戏团”的团长，头戴高帽，脸上有圆圈、水滴、新月型彩妆，相貌诡异的男子，经常面带庛牙裂嘴的笑容并手持鞭子，主旨是“要带给观众热血沸腾的娱乐”。对底下员工相当严格，只要员工表现稍不合意，就会以调教动物的方式给予鞭打训斥，甚至有将随手捻来的任何杂物（例如钥匙）吞下的习惯。据铃木所说，自从志乃万和道乃家结下契约后，道乃家的性格也变得相当残暴。
菊地（きくち）
华学校里的A组学生，性格温文腼腆，说话略有口吃的少年。平时性情胆怯，不擅看着他人的脸说话，经常有向人道歉的习惯。小时候因为见到马戏团的表演感到兴奋，加上偶然见到“八时马戏团”的征人广告单，为了改变自己而开始在“八时马戏团”兼差。对华相当了解动物一事略有耳闻。因为偶然听见马戏团里的熊说人话，又刚好在街上遇到华，因此向她请教有关熊会说话的秘密。在马戏团事件里奋力保护华，后来和铃木与椎名等人挺身反抗志乃万。
铃木（すずき）
“八时马戏团”的动物调教师。性格友善且相当有礼貌，很照顾刚进马戏团的菊地。在托依托依还是小狗的时候便负责照顾与训练她，因此托依托依非常喜欢他。称呼蟒蛇“梅杜莎”，同时也是少数察觉马戏团内异常迹象的人类。于马戏团事件和托依托依负责看守监禁椎名、蟒蛇、歧佐藏的笼子，因为椎名使用魔力让蟒蛇脱困又再次使其人化，被人化的蟒蛇诱惑，间接导致托依托依为了博取他的认同对蟒蛇动粗。后来铃木对败北的托依托依提出劝诫，令托依托依正式向他致歉，并且和菊地与椎名等人挺身反抗志乃万。
【动物】
托依托依（トイトイ）
贵宾狗，性别为母，人化时为戴着贵宾狗头帽，双手附着卷绒毛，穿戴卷绒毛短衣裙与狗脚靴的短发少女，在所有马戏团的人化动物当中，她的外貌最接近人类。对菊地抱持不以为然的态度。从小就被铃木收养训练，因此相当喜欢铃木。因为是狗所以拥有足以和大上匹敌的优异嗅觉。于马戏团事件和铃木负责看守监禁椎名、歧佐藏、蟒蛇的笼子，因为见到人化的蟒蛇意图向铃木索取钥匙大感不悦，为了取得铃木的认同与蟒蛇展开决战，企图用摩托车攻击蟒蛇未遂，反让蟒蛇使出“密技 蛇分身”夺得钥匙而败北。事后蟒蛇打了托依托依一记耳光，还训诫她“真正喜欢对方，就该为对方着想，做让对方高兴的事”，最后托依托依在铃木的劝谏下感动流泪，正式对铃木致歉，并且在改称蟒蛇“姐姐”的同时，对椎名等人透露马戏团被志乃万操控的真相。
白虎（ビャッコフ）
白老虎，性别为公，人化时头戴飞行员帽，四肢套著虎爪状的护甲。虽然出生西伯利亚，但不同于一般的老虎，他有着相当罕见的黑白毛色（通常只有分布在孟加拉和印度的白老虎才有这种毛色）。性格凶暴好战，擅长格斗，徒手战斗时动作较迟钝，一旦认真战斗就会拿出藏在毛皮中的拐，加上老虎的肩膀和前脚原本就很发达的关系，使他不但拥有可怕的破坏力，还能连续使出快到让对手无法预测的攻击，口头禅是“咬碎”，认为差劲的人就应该被他除掉，能够一口咬碎20公斤的铁哑铃，但头脑相当不灵光，一旦奋力攻击对手就有咬牙和用爪子撕碎物品的习惯。于马戏团事件对上斯斯德并重创对方，随后华为了保护斯斯德将白虎撞开，此举让斯斯德忆起椎名保护同伴的承诺并起身保护华，而斯斯德也察觉到白虎有用牙齿紧咬物品时就一定不会松口的缺点，趁著它打算再次使出“虎式里技”给予最后一击时以抢来的拐棍反击，最终它因为下意识的咬住拐棍被斯斯德以“狮子老虎摔”彻底击败。
罗迪欧（ロデオ）
英国纯种马，性别为公，人化时为面套缰绳环、身穿窄袖外套、手腕配戴铁蹄状手环、系著皮腰带、手持束鞭的半人马。性格冷静且严格，加上纯正的血统使他相当高傲，视自己以外的人为下等生物（尤其是既粗暴又愚钝的肉食动物），似乎特别喜欢“调教”这个字眼。他的视野可达350度（一般的马则是330度），因此在战斗时绝对不能从他后方攻击。于马戏团事件受志乃万指挥，将华与斯斯德关入笼子里。 鼻上向夫（はなうわむきお）
10岁小学生，是牛见建设社长鼻上向内的儿子。一次到深山采集昆虫时目睹椎名和华以及动物园动物们经过，于水族馆事件后拜访动物园，成为动物园的第一批访客，还认出华正是当时与动物园动物一起行动的人，并称呼华“大姐姐”，在参观动物园的时候险些被岐佐藏的巨足踩到，但向夫不但不引以为惧，反而为这般魄力感到惊喜，并且在离开前表示还会再来参观动物园。父子俩的拜访事件，让椎名的左手肘恢复原貌。
鼻上向内（はなうわむかない）
牛见建设社长，是丑三时刻水族馆赞助商，留着黑卷发与长垂鼻的胖男子。向夫的父亲。于水族馆事件后拜访动物园，成为动物园的第一批访客，在参观动物园的时候被猩猩金刚丢大便，还因为目睹向夫险遭岐佐藏踩死吓出一身冷汗，之后表示再也不愿意来造访。父子俩的拜访事件，让椎名的左手肘恢复原貌。
三浦育美（みうらいくみ）
头发束成簪状的少女，华的同班同学，性格骄傲，以“失败女”、“不管有多努力都绝对得不到任何回报”的语句嘲笑做事笨拙的华，但偶尔也会对表现华关切的态度。
典子（のりこ）
戴眼镜的长发女孩，华的同班同学。 在作品中短暂登场，清一色为身形巨大，有着生物特征的妖怪，专门守护某个领域的动物，不让它们被人类侵害；若是有人类入侵他们守护的领域伤害生物，就会被他们留下诅咒。
兔妖怪
于漫画第1话椎名的回忆登场，守护林地的兔妖怪。颈部挂著串珠项链般的钟表，牙齿尖锐，拥有人类般的巨手。于十几年前，对当时在他的领地追捕野兔的年幼椎名留下诅咒，并告诉他“要解开诅咒，就要向生命表示怜爱，招集更多动物，用力量创造能让天下皆知其名，让世界震惊的乐园”。留下的这番话，成为椎名创立逢魔时刻动物园的原因。
抹香鲸妖怪
于漫画第21话伊佐奈的回忆登场，守护海洋，身形远比一般抹香鲸还要巨大数倍的抹香鲸妖怪。对当时在海上狙杀鲸鱼的伊佐奈留下诅咒，他要求伊佐奈 “如果想解除诅咒就用这股力量创造出轰动世界的生命之层”，并且将伊佐奈当时乘坐的游轮一并击沉，但为了让伊佐奈悔改故没有取其性命。
棕熊妖怪
于漫画第33话提及，对志乃万留下诅咒的棕熊妖怪。
