一、性质不同
1、膜转运蛋白：或是大的跨膜分子复合物，一种不同的运输蛋白机制。
2、载体蛋白：多回旋折叠的跨膜蛋白质，它与被传递的分子特异结合使其越过质膜。
二、机制不同
1、膜转运蛋白：参与被动运输(促进扩散)或主动运输(运输泵)。参与促进扩散的膜运输蛋白虽然没有酶活性，但是具有酶催化的特点。
2、载体蛋白：载体蛋白分子的构象可逆地变化，与被转运分子的亲和力随之改变而将分子传递过去。
扩展资料：
膜转运蛋白和载体蛋白的其它相关介绍：
载体蛋白有的需要能量驱动，如：各类ATP驱动的离子泵；有的则不需要能量，以自由扩散的方式运输物质载体是一种允许和帮助水溶性物质渗入并穿过细胞膜的脂质层而转移到细胞中去的物质。
载体蛋白在膜的一侧与离子特异性地结合，形成不稳定载体--离子复合物，然后在膜的另一侧把离子释放出来，而载体又回到原来一侧.细胞膜上一定的蛋白质，可以使一定的离子通过。
活细胞的情况与人工脂膜有所不同。绝大多数代谢上重要的分子和无机离子都不溶于脂，但事实上，它们却可以有效地进出活细胞，而且有精细的控制机制。
使其在细胞内外达到适度的浓度梯度，形成一定的膜电位差，这不是简单的扩散，而是通过质膜上特殊的装置——运输蛋白选择性透过的结果。
参考资料来源：
参考资料来源：