孔乙己一共出现在咸亨酒店四次，每次都与人作简短的对话（第一回向群众申辩窃书不能算偷。
第二回与小伙计对话。第三回的对话是对贪吃的小孩子说的。
第四回是与掌柜的对话）： 一、“你怎么这样凭空污人清白……” “窃书不能算偷……窃书……读书人的事，能算偷么？” 二、“你读过书吗？” “读过书，……我便考你一考。茴香豆的茴字怎么写的？” “不能写吧？……我教给你，记着！这些字应该记着。
将来做掌柜的时候，写账要用。” 三、“不多了，我已经不多了。”
“不多不多！多乎哉？不多也。” 四、“温一碗酒。”
“这……下回还清罢。这一回是现钱，酒要好。”
“不要取笑！” “跌断，跌、跌……”。
从第四段到倒数第二段是第二部分，这是整篇小说的主体部分。
这一部分又可分为两个层次：从“孔乙己是站着喝酒而穿长衫的惟一的人”到“于是这一群孩子都在笑声里走散了”可以作为第一层，其余的段为第二层。在第一层中，作者以一系列生动逼真又极具概括力的细节，传神地刻画了孔乙己的迂腐性格，展示了他的不幸遭遇；第二层则通过一个具体事件表现了孔乙己命运的突转：他因偷窃而被权势显赫的丁举人家打折了腿，成了一个彻底的“废人”，使他连最起码的生存条件都难以维持了，但还是对掌柜的说是跌断的。
小说突现了孔乙己最后一次到咸亨酒店买酒、在别人的耻笑声中用手“慢慢走去”的凄惨场景。最后一段为第三部分，可以看做小说的尾声。
作者用短短的一句话将叙述者“我”的思绪从二十多年前的过去回到“现在”，以“我”的亲身见证来推测孔乙己“大约的确死了”，在首尾呼应中强化了孔乙己的人生悲剧，含蓄地表达了一种深沉的抗议与批判。