社保卡在购买药品时的扣费机制是根据医保的两个账户进行的。首先，个人账户（通常在医保卡内）主要用于在指定药店购买药品，以及支付门诊和住院费用中个人需要自付的部分。这部分资金可以直接用于消费，无需先垫付后报销。
其次，统筹账户由医保中心管理，它负责处理符合当地医保报销条件的费用。当参保人员在定点医院就医时，只需出示社保卡以确认身份，医疗费用中的自付部分由个人通过医保卡或现金支付，医保报销的部分则由医保部门和医院直接结算，无需个人先行支付再申请报销。
使用社会保障卡进行医疗事务处理的一大优点是，个人账户余额可以结转使用，不会因为更换卡片而失效。这意味着即使更换社保卡，参保市民的个人账户资金也不会丢失。总的来说，社保卡的使用与原有的医保待遇保持一致，市民仍按所在省市的《职工基本医疗保险办法》享受保险服务，无需过多担心账户管理问题。