劳动者依法辞职后被用人单位克扣工资时的办法，就是应当及时维权确保自己的合法权益。电话12333是全国统一劳动保障监察机构咨询、举报、投诉电话。
如果劳动者依法辞职后被用人单位克扣工资，劳动者就应当依法向当地的劳动保障监察大队进行书面举报或者投诉，要求用人单位支付拖欠的工资，同时按照应付克扣金额的0.5以上1倍以下的标准向劳动者加付赔偿金。或者，劳动者依法直接向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁(劳动争议仲裁不收费)，对仲裁不服的，还可以依法向法院提起诉讼(劳动争议案件10元/件)打官司。
《劳动合同法》第77条 劳动者合法权益受到侵害的，有权要求有关部门依法处理，或者依法申请仲裁、提起诉讼。
《劳动保障监察条例》第26条 用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额或者解除劳动合同的经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金：
⑴ 克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的；
⑵ 支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的；
⑶ 解除劳动合同未依法给予劳动者经济补偿的。