广东省交通运输厅根据其职能设立了多个内设机构，具体如下：
办公室（与机关党委办公室合署）：负责日常事务如文电处理、会务组织、保密管理、信访、政务公开和对外宣传工作，同时指导直属单位的党群及思想政治工作。
政策法规处：负责行业体制改革和结构调整，草拟法规草案、政策措施，并监督实施，处理行政复议和应诉事务，指导依法行政和普法教育。
综合规划处：负责综合交通运输体系规划，参与物流业发展和规划，管理交通建设项目，提出投资建议，参与交通战备和救灾工作，以及外资交流。
综合运输处：监管道路运输市场，组织重点物资运输，管理省际和省内跨市旅客运输，协调多种运输方式衔接，处理相关跨部门事务。
基建管理处：负责公路、水路建设市场的监督，管理工程质量、造价和工程定额，参与项目审查和验收，指导公路养护和农村公路建设。
地方铁路处：制定地方铁路规划，负责管理规程和技术规范，监督工程建设市场，拟定投融资办法。
收费管理处：拟订规费政策并监督实施，管理收费公路和收费站，推进联网收费，负责政府还贷公路的收支管理。
安全监督处（应急办公室）：制定安全生产规章制度，指导和监督安全生产，处理事故调查和上报，负责机关及直属单位的安全保卫工作。
财务审计处：编制预算和决算，管理交通资金，监督资金使用，负责国有资产管理和内部审计。
科技处：规划科技、教育、信息化发展，组织科研项目，指导行业环保和节能减排。
人事处（与离退休人员服务处合署）：管理人事、机构编制和劳动工资，负责直属单位领导干部管理，负责离退休人员服务。
交通运输综合执法局：监督全省交通执法，承担监督检查、行政处罚和行政强制工作，组织查处重大违法案件。
港航管理局：参与水运和港口政策制定，负责水路运政和港口行政管理，监管港口设施，管理相关业务和规费。
扩展资料广东省交通运输厅为省人民政府组成部门，根据《中共广东省委、广东省人民政府关于印发〈广东省人民政府机构改革方案〉的通知》（粤发〔2009〕8号）设立。2009年10月21日上午，广东省交通运输厅挂牌成立。新组建的广东省交通运输厅承担了原省交通厅的职责、原省建设厅指导城市公共客运的职责，以及交通战备工作、地方铁路建设等职责。这是广东省交通行政管理体制的一次重大变革，交通运输厅的挂牌成立，标志着广东省交通运输事业发展进入新的历史时期。