河南省人民政府外事侨务办公室(同时也是河南省人民政府港澳事务办公室)，为了履行其职责，设有以下九个内设机构:
(一)综合处：负责机关的文书处理、机要事务、会议安排、档案管理、信访工作、安全保密，以及财务行政和重要活动组织等。同时，负责省委外事工作领导小组办公室的日常工作。
(二)人事处(机关党委)：负责机关及直属单位的人事管理、机构编制，包括党群工作、机关离退休干部管理和指导直属单位的离退休工作。
(三)亚非处：主要负责全省的涉外礼宾事务，与亚洲和非洲地区的交往工作，研究这些地区国家的情况，接待重要外宾，以及管理对外友好交往活动等。
(四)欧美处(翻译室)：负责全省与欧美地区的交往，包括接待外宾、处理涉外事宜，以及与驻该地区国家使领馆的联络工作，处理邀请外宾访问的相关事务。
(五)涉外管理与新闻处：指导全省的涉外管理工作，处理涉外事件，管理境外非政府组织在豫活动，审核外国人来豫签证，审批国际会议等，还负责对外新闻事务和外国专家管理工作。
(六)出国管理处：管理全省因公出国(境)的计划和审批，负责副厅级以上干部的出国(境)申报审核，处理出国(境)相关问题，管理护照和签证等，以及对出访团组进行纪律教育和监督。
(七)国内侨务处：研究省内侨务工作，维护归侨侨眷权益，负责归侨侨眷的救济和扶贫工作，处理涉侨投诉，监督捐赠财产使用，并协助人事安排。
(八)国外侨务处：研究国外侨务工作，推动对华侨华人社团的联络和服务，通过侨务渠道开展对台工作，负责涉侨事项审核，推动侨务宣传和华文教育，管理海外寻根活动，促进经济科技合作。
(九)港澳处：负责与香港、澳门的联络事务，推动两地在多个领域的交流与合作，管理公务人员赴港澳事宜，依法管理港澳新闻机构和记者事务，协调重大交流活动，参与港澳民间交往的管理，维护港澳同胞在豫权益。
根据《中共河南省委河南省人民政府关于印发河南省人民政府机构改革实施意见的通知》(豫文〔2009〕18号),设立河南省人民政府外事侨务办公室(河南省人民政府港澳事务办公室),为省政府组成部门。