内蒙古机电职业技术学院拥有丰富的专业设置，学院内部设有9个教学系部，包括机电工程系、电气工程系、冶金与材料工程系、水利与土木建筑工程系、信息与管理工程系、继续教育学院以及教学实习部。这些系部涵盖了广泛的专业领域。
目前，学院共设有25个专业（已获得批准的专业总数为33个），专业设置以制造类、材料与能源类和水利类为主导，形成了较为完整的专业结构。在这些专业中，机电一体化技术、数控技术以及电气自动化技术三大专业尤为突出，被自治区认定为品牌专业，体现了学院在这些领域的专业实力和领先地位。
内蒙古机电职业技术学院成立于2003年，是经内蒙古自治区人民政府批准、国家教育部备案的培养理工科高素质高级技能型专门人才的公办全日制普通高等学校，前身为1952年创立的内蒙古工业学校，是自治区成立后建立的第一所工科学校。全额拨款事业单位，直属自治区教育厅。学院是“国家示范性高等职业院校建设计划”骨干高职院校立项建设单位。连续3年被内蒙古自治区教育厅评为普通高等学校毕业生就业工作先进集体。