荆门市发展和改革委员会的内设机构包含多个部门，承担着不同的职责。以下是主要部门的概述：
1. 办公室（政策法规科）：负责文秘事务，包括会议组织、文电档案管理、保密、提案建议、目标责任制管理、电子政务、政务公开等，并负责财务、资产管理、后勤协调和综合协调工作。同时，它还负责新闻发布和文件合法性审核，以及行政执法和法制宣传教育的指导和监督。
2. 发展规划科（服务业发展科）：负责提出全市中长期发展战略，组织拟订发展规划，并对实施情况进行监测评估。此外，该科室还研究服务业发展策略，负责服务业项目的实施和经济运行监测。
3. 国民经济综合科：负责年度国民经济和社会发展计划的制定，分析经济形势，提出措施建议，并参与经济形势分析会议的日常工作。
4. 经济体制改革和开发区管理科：研究改革和对外开放问题，制定综合性改革方案，协调专项改革，以及推进企业上市工作。
5. 固定资产投资科（行政审批科）：研究投资调控政策，安排预算内投资，应对灾害应急，负责行政审批和核准工作。
6. 财金贸易和对外经济科：研究财政货币政策，推动直接融资，负责企业债券发行，参与价格调控，推进股权投资基金发展，以及外资和外贸战略规划。
7. 地区经济科：负责区域经济发展政策，协调区域合作，参与国土整治、开发和环境保护等工作。
8. 农村经济科：研究农村经济发展，编制农业和农村经济发展规划，监督执行和分析调控。
9. 能源科：提出能源发展战略，管理能源行业，包括电力、新能源、煤炭、石油和天然气等。
10. 综合交通科：负责交通运输规划，协调交通项目，参与国防交通工作，以及铁路建设。
11. 工业科：推动工业结构调整，制定工业发展政策，协调企业技术创新和动员工作。
12. 高新技术产业科：研究高技术产业发展策略，推动技术创新和产业化工作。
13. 资源节约和环境保护科：负责资源节约和环境保护，包括节能减排和应对气候变化工作。
14. 社会发展科：协调社会事业发展，编制相关领域规划，研究就业、收入分配和社会保障问题。
15. 市重点项目建设办公室：负责重大项目管理和协调，进行项目稽察和后评价。
16. 人事科：负责委机关及下属单位的干部人事管理和机构编制。
其他支持部门如机关党办、纪检监察机构和老干部科也分别负责相应的党务、纪检监察和退休干部管理工作。