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序列比对结果怎么看
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答:
关于
序列比对结果怎么看
,
序列比对结果如何看
这个很多人还不知道,今天来为大家解答以上的问题,现在让我们一起来看看吧!1、我都是根据 Query coverage ,其实排在前面的几个要么就是你Blast的那个核苷酸序列,要么是这个序列的全长或染色体上的DNA序列。2、你看看前几个位置的Description,就可以确定你...
ncbiblast
序列比对结果怎么看序列比对结果怎么看
答:
1、到NCBI用BLAST,很简单的。2、把你的
序列
贴上去,选物种,然后就可以了。本文到此分享完毕,希望对大家有所帮助。
序列比对
gap数值
怎么看
答:
为了求得最佳
比对
而引入的。根据查询CSDN博客显示,gap数值即空位,是为了求得最佳比对而引入的,是假设
序列
进化过程发生了插入、缺失的进化事件,空位的罚分应比非匹配位点更严厉(空位罚分),因为任何两序列在自由引入空位后最终可使所有相同残基的位点都比对上。
在Blast里面进行
序列比对
,相似度主要看哪个值
答:
主要是看后面的相似度,Query coverage 值,用百分之几来表示的,百分数越高,表示相似度越高
,还有一个是E value ,这个值越小的话表示相似度越高。
本地blast
序列比对结果怎么看
答:
择和输入要跟你的
序列比对
的序列种类和物种。下面的Entrez Query 可以对
比对结果
进行适当的限制。Program Selection 部分其实是让我们选择本次比对的精确度,种内种间等等。在BLAST 按钮下面有一个“Algorithm parameters” ,这是参数设置选项,一般用户 使用不到此项,所以它比较隐蔽,点击,原网页下方即可...
基因
序列比对结果
,这个样子
怎么
解释?
答:
为了实验方便,可以重新设计一下。至于你对比的
序列
,有一个缺失或者是多出来一个,都是有可能的,建议你从新做一些反转录,看看再扩增出来测序
结果怎么
样。并且有这么一个缺少或者插入,只要不是引物中间的,对引物的敏感性就没有明显影响。不影响realtimePCR试验的结果。
如何
将两个
序列
进行
比对
答:
1、网络搜索下载并安装BioEdit软件。2、将你所要
比对
的
序列
以fasta格式粘贴在文本文档里。3、BioEdit软件打开文本文档,选中所有的序列,按下图方法选择要打开的标签。4、在新的窗口中,按下图所示勾选Note下面的方框(勾选之后可以在比对的
结果
中用星星表示,方便你看出哪些地方不一致)和运行“RunClustalW...
关于使用blaste进行
比对
的
结果
分析
答:
前面的数字表明是第几个氨基酸。+号表示性质相似的氨基酸。———Identities是完全一样的氨基酸,而Positives则是性质相似的氨基酸比例。下面的那三条序列,Query是数据库里的序列,sbjct是你提交的序列,中间的是两条
序列比对
的
结果
。懂么?
序列比对
的序列比对的统计检验
答:
常用
序列比对
程序通常给出一些统计值 ,用来表示结果的可信度。BLAST程序中使用的统计值由概率p和期望值e。概率p表示
比对结果
得到的分数值的可信度。一般来说,p越接近于0,则比对结果的可信度越大。期望值e描述搜索某一特定数据库时,随机出现的匹配序列数目。
如何
在进行基因
序列比对
答:
1、搜索找到NCBI方网站。2、找到BLAST选项并点击进入。3、在“Basic Blast”内找到核酸blast并点击进入。4、在输入查询的对话框中打入目标
序列
, 勾选“Align two or more sequences”,可以输入两个以及三个以上的序列选项进行对比。5、把两段或者两段序列输入后,点击Blast进行
比对
,几秒钟后
查看结果
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