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dnaman反向互补序列
什么叫“
反向互补序列
”???
答:
互补序列:TTAAGGCC 就是与原
序列互补
;反向互补:CCGGAATT 就是与
反向序列
互补。二、概念不同:互补的概念就是A-T,C--G配对 要将核苷酸序列转换成
反向互补序列
,需要用DNASTAR软件,其中有EditSeq组件。三、序列编码不同:在用
DNAMAN
的多序列比对时,包括编码链和非编码连的比对,测序得到的目的片段...
上下游引物测序结果如何对比
答:
一个不变,一个
反向互补
。在
DNAMan
上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的
序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。
关于TA克隆测序结果的几个问题,用的是PMD19-T Vector.
答:
1.直接用F或R测序,看有没有插入片段;或拿载体两端的特定的限制性酶切一下质粒,看有没有片段切出来;2.用生物学软件比如
DNAMAN
等得到
反向
互补序列,再比对,
请问拿到测序的结果,怎么找不到引物
序列
?
答:
你应该在
DNAMan
上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个
反向互补
),如果比不上,那可能就不是你要的
序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。
请问拿到测序的结果,怎么找不到引物
序列
?
答:
你应该在
DNAMan
上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个
反向互补
),如果比不上,那可能就不是你要的
序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。
如何对基因测序结果进行分析
答:
测序得到基因
序列
后一般都需要进行序列比对,看和目的序列的差异情况,常用的软件有
DNAman
,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。克隆至质粒载体中后集中测序〔9,10〕。sAGE的最终结果是通过计算机统计得到的,根据某个标签出现频率的高低来...
为什么我在NCBI上找一段基因,结果只有一条链?求大神指导
答:
DNA本身是双链,两条链
反向互补
,所以NCBI上下载时只有一条,而且平时分析
序列
时也是通过一条链分析,如果想要双链的序列,可以使用类似
DNAMAN
的软件通过反向互补补充另一条链即可。
什么是拼接
序列
答:
送去公司 双向测序后的 一个一个的基因片段 然后用
DNAMAN
软件中的merge 功能直接进行序列连接。或者先将逆向测定序列转换为它的
反向互补序列
,再和正向序列进行 比较,找到两者的重叠序列,剔除反向互补序列中的重叠部分,将其余的连接带正向序列之后即可得到 拼接序列 ...
怎样通过已知基因
序列
和引物序列 测算PCR产物大小
答:
在你的已知基因
序列
上是可以找到引物上的全部序列和一部分序列的。比如说前引物对应已知基因的21-40bp,后引物对应于已知基因的821-840bp,那么你的PCR产物大小就是820bp(840-21+1).]
怎样能将
DNA序列
从
反向
换算成正向?
答:
你说的是
反向互补
还是直接反向?可以用primer或者
DNA
STAR.那就反向互补一下看。
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