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有菌但是测序测不出来
无条带不
测序
什么意思
答:
基因组序的方式。条带是基因组序中的一种罕见形态,在
菌
液PCR
测试
中出现。经查询基因组序官网资料显示,无条带代表着在一组对比实验中的其一菌落对照内无条带,没有办法按照顺序测照dna顺序。该技术帮助了很多农作物的成长,深受广大科研者的喜爱。
测序
时发现百分之九十多都是载体序列另外还能找到自己的引物是怎么回...
答:
说实话,克隆时偶尔会出现一些难以理解的事情,我还遇到过引物序列不停重复然后插入
到
了载体上,遇到过只插入部分目的序列,还遇到过PCR出来有条带,
测出来
是空载。经验丰富的实验师也好,有名的大教授也好,也不知道这只偶然现象为什么会发生。
测序
时目的片段长度怎么写,要对一个细菌做鉴定,看它是不是细菌性穿孔...
答:
测序
订单上目的片段长度即你扩增的基因片段大小。做细菌鉴定,可以采用最常的16s rRNA的通用引物,例如27F/1492R等进行PCR扩增,扩增所得1500BP左右的片段进行测序,测序结果再与数据库中的序列进行比对确认,是否是细菌性引起的问题。
...一个是PCR片段上的 鉴定正确后
测序却
完全不同?信号中断?
答:
是定向克隆粘末端连接?如果不是有连接反了的可能 再有一种可能就是送去
测序
的
菌
液有问题 我有次是同样的片段测序,菌液没
出来
,用测序引物PCR的产物测序就合适了,可能菌液污染了
测序
结果能知道各个细菌种类的含量分别是多少吗
答:
一般确定各个细菌种类的含量,专业上讲叫种群丰度 一般观察这种丰度细菌是通过16S rDNA的高变区V区来确定物种 一代
测序
是通过PCR来扩增出特定V区,进行克隆后,一代测序进而分析,
但是
克隆挑选的数目对丰度的准确评估有很大影响(越多越好)二代测序pcr后直接进行测序,来找特定丰度,二代测序的高通量有...
基因组提取实验中,是否会
有细菌
基因组的污染?为什么
答:
操作环境:在进行基因组提取实验的过程中,操作员的动作和空气中的菌落也可能带来一定的细菌基因组污染。操作员呼出的气体或在操作中飞散的颗粒会有挥发的细菌,这些都可能在实验过程中污染样品。细菌基因组的污染不仅会影响
到
提取到基因组的纯度和质量,还会导致RNA
测序
的顺利进行等后续实验的结果受到影响。
划线挑
出来
的
菌
要送去
测序
吗
答:
需要送去
测序
。将重组质粒导入大肠杆菌感受态细胞,涂板,过夜培养出现单菌落,接着做菌落pcr,出现正确条带后将对应的单菌落接入液体培养基,amp浓度是50微克每ml。
denovo
测序
能
测到
rna病毒吗
答:
两种情况。逆转录病毒/噬菌体,整合部分基因组到宿主中,对宿主进行de novo
测序
时可能测得部分病毒序列。其他病毒,如果有polyA,可以测mRNA的时候
测到
病毒基因组。如果目的就是测病毒,建议直接准备样品送公司做病毒测序。
高通量
测序
中如何判断土壤微生物数量的多少?
答:
有了微生物16S rDNA序列,不论是全长还是部分,都可以提交
到
GenBank采用BLAST程序与已知序列进行相似性分析。Gen Bank将按照与测得序列的相似性高低列出已知序列名单、相似性程度以及这些序列相对应的微生物种类,
但
更为精确的微生物分类还取决于系统发育分析(phylogenetic analysis)。高通量
测序
的优越性体现在:测序序列长...
菌
液活化后送去
测序
之前是不是要保种
答:
菌
液活化后送去
测序
之前是要保种。根据查询相关公开信息显示,菌液进行长时间保存,并且需要多次使用,需要在菌液活化后先进行保种,以便后续使用,保种一般包括将活化后的菌液进行分装、用琼脂糖培养基培养、加入甘油等步骤,以便在低温下保存。
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