2002年06月，摩根士丹利等机构投资者在开曼群岛注册了开曼公司
2002年09月，蒙牛乳业的发起人在英属维尔京群岛注册成立了金牛公司。同日蒙牛乳业的投资人、业务联系人和雇员注册成立了银牛公司。金牛和银牛各以1美元的价格收购了开曼群岛公司50%的股权，其后设立了开曼公司的全资子公司—毛里求斯公司。所投资金经毛里求斯最终换取了大陆蒙牛乳业66.7%的股权，蒙牛乳业从民营企业变为合资企业。
2009年7月，中粮投资61亿港元收购蒙牛20%的股权，中粮成为蒙牛第一大股东。总部设在中国乳都核心区――内蒙古和林格尔经济开发区，截至2009年拥有总资产300多亿元，职工近3万人，乳制品年生产能力达600万吨。到目前为止，包括和林基地在内，蒙牛乳业集团已经在全国16个省区市建立生产基地20多个，拥有液态奶、酸奶、冰淇淋、奶品、奶酪五大系列400多个品项，产品以其优良的品质荣获“中国名牌”、“民族品牌”、“中国驰名商标”、“中国品牌500强《中国品牌价值研究院》”、“国家免检”和消费者综合满意度第一等荣誉称号。它与IT行业的联想、网络行业的阿里巴巴、电器行业的海尔等都是行业的顶级品牌.也是中国最具价值品牌之一。
2008年09月19日，国家质量监督检验检疫总局撤销内蒙古蒙牛乳业集团股份有限公司液态奶产品中国名牌产品称号。
蒙牛乳业07月6日晚间在香港联交所发布公告,公司将以每股17.60港元的价格,向中粮集团和厚朴基金联合投资成立的新公司出让蒙牛20%的股权,涉及交易金额高达61亿港元,从而成为蒙牛乳业的第一大股东，宁高宁入驻蒙牛董事会，成蒙牛非执行董事。
2010年11月22日，蒙牛宣布与君乐宝乳业合作，以4.692亿的价格持有君乐宝51%股权，将这一华北市场的对手收入囊中，也最大限度的扩充了自己的酸奶产能。据悉，君乐宝总体股权估值为9.2亿元。
此次合作之后，蒙牛集团旗下公司的酸奶市场份额将提升至30%以上，蒙牛和君乐宝两个品牌也将由原来各自为阵结成统一战线。蒙牛公布年报数据显示，06-09年蒙牛酸奶复合增长率为27.3%，2010年上半年的同比增长率更是达到30.3%。君乐宝是华北地区最大的酸牛奶生产基地，酸奶市场占有率居全国第四位，在其年营业额12.6亿中，高达84%的业绩来源于酸奶。
根据框架协议，君乐宝股权价值最终评估为9.2亿元，蒙牛收购其51%的股权，价格为4.692亿元；合作后的君乐宝经营层维持不变，“君乐宝”也将作为独立品牌运作。交易完成后，君乐宝董事会成员为7人，其中蒙牛提名董事4名，蒙牛委派首席质量官、财务负责人到君乐宝。君乐宝在奶源、产品质量、市场方面与蒙牛协同，在财务会计政策标准方面与蒙牛统一。
2012年04月12日，蒙牛乳业表示根据公司章程规定，总裁杨文俊两届任期已满，经董事会同意，不再兼任总裁一职，总裁一职由孙伊萍接任。蒙牛彻底进入中粮时代。
2013年6月18日，中国蒙牛乳业有限公司（简称“蒙牛乳业”）与雅士利国际控股有限公司（简称“雅士利”）联合宣布，蒙牛乳业向雅士利所有股东发出要约收购，并获得控股股东张氏国际投资有限公司（简称“张氏国际”）和第二大股东凯雷亚洲基金全资子公司CA Dairy Holdings（简称“CA Dairy”）接受要约的不可撤销承诺，承诺出售合计约75.3%的股权。
这是迄今为止，中国乳业最大规模的一次并购,也是蒙牛乳业在奶粉领域发力的重要信号。两大乳业巨头联手后，将通过资源整合与互补，利用双方在产品、品牌、渠道等方面的优势，加快高端奶粉行业整体升级的速度。
2015年08月，蒙牛乳业荣登《中国制造企业协会》主办的“2015年中国制造企业500强”榜单，排名第48位
2015年8月28日，“蒙牛”品牌荣登《中国品牌价值研究院》主办的“2015年中国品牌500强”榜单，排名78位。
蒙牛乳业在港发布2015年报。去年一年，蒙牛实现销售额490.265亿元，净利润23.67亿元，实现净利润约0.7%个点的增长，蒙牛旗下明星品牌特仑苏、冠益乳、纯甄、优益C等依然保持较好增速，低温酸牛奶市场份额保持领先。
2015年07月29日，荷兰合作银行公布的2015年度“全球乳业20强”榜单中，蒙牛凭借稳健的综合表现排名第11位，相比去年排名连续上升3位。这也是蒙牛连续7年入围此榜单。
2016年09月15日，卢敏放出任蒙牛乳业总裁。原蒙牛乳业总裁孙伊萍已辞任。
2017年07月12日，2017年“全球乳业20强”榜单，蒙牛跃居榜单前10强，排名上升一位。
2017年9月7日，蒙牛乳业与阿里巴巴在杭州正式签署战略合作协议，双方未来将在线上销售、品牌建设等方面展开多领域深化合作 。
2017年12月20日，蒙牛正式成为2018年 FIFA 世界杯全球官方赞助商。
2018年2月24日，蒙牛集团再度宣布重磅消息——签约阿根廷球星里奥 · 梅西（Lionel Messi）成为其2018品牌代言人，由此揭开了蒙牛主题为“自然力量 · 天生要强”的品牌升级行动。
2018年6月5日-6日，奶牛金钥匙技术示范蒙牛示范专场活动在河北廊坊举行。
2019年9月16日，蒙牛(02319)拟近80亿港元收购澳洲贝拉米 婴幼儿奶粉配方及市场双重利好吸引。
蒙牛乳业11月25日又宣布一项重磅交易：拟以6亿澳元（约合人民币28.7亿元）收购澳大利亚乳品和饮料公司Lion-Dairy & Drinks（下称：LDD）100%股份。后者目前隶属于日本麒麟公司。
2020年2月1日，蒙牛在已经捐赠8000万款物基础上，蒙牛集团宣布追加捐赠6.6亿元产品，这是9天内蒙牛第6次捐赠。捐赠款物分配将由中华慈善总会、各地慈善总会统筹执行，产品将日均送达上千医院和抗击一线。
疫情暴发以来，蒙牛集团持续为抗“疫”前线捐钱、捐物。1月22日，蒙牛向武汉捐出第一批产品，牛奶物资率先运抵火神山、雷神山工地和武汉多家重点医院，为奋斗在一线的医护人员、建设者送上营养助力。
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