新生儿医保报销比例：镇卫生院报销60％；二级医院报销40％；三级医院报销30％。
在新生儿出生的九十天之内，完全可以参加居民的医疗保险，可以报销任何治疗费用。也就是说参加前新生儿如果生病了，那么就无法参加医院报销。但是如果在这九十天之内，新生儿出现住院的情况，那么就可以报销，并且报销力度比较大，不用太担心。当新生儿出现疾病的时候可以放心住院治疗。
新生婴儿住院能报销，但是只是指刚刚出生三个月之内的婴儿。这个时期的婴儿，如果出现身体方面的疾病的话，家长可以带新生婴儿去住院治疗，然后家长可以到当地社保局进行报销政策很不错，减少了更多费用的疑虑。总而言之新生儿是否能报销住院费用，要看新生儿的年纪，是否处于90天中。
新生婴儿三个月之内的住院费用都是可以通过报销解决的。家长们在给新生儿看病的时候，一定要注意，保留好新生儿看病的各种单据，不要让新生儿看病的单子弄丢，这样才可以报销更多。
住院医保报销流程及注意事项：
1、入院或出院时都必须持医疗保险IC卡到各定点医疗机构医疗保险管理窗口办理出入院登记手续。住院时个人先预交医疗费押金，出院结帐后多还少补。未办理住院登记手续前发生的医疗费不纳入基本医疗保险支付范围。因急诊住院未能及时办理住院登记手续的，应在入院后次日凭急诊证明到医疗保险管理窗口补办住院手续（如遇节假日顺延），超过时限的医疗费自负。
2、参保人员住院后统筹基金的起付线：起付线各地标准各有不同一般为上年度全市职工年平均工资的10％，在一个基本医疗保险结算年度内，多次住院的医疗费累计计算。
3、参保人员因病情需要转诊或转院的，须经三级以上定点医疗机构副主任医师或科主任诊断后提出转诊（院）意见，由所在单位填报申请表，经定点医疗机构医疗保险管理部门审核同意报市（区）社保机构批准后办理转诊（院）手续。
以上内容参考：百度百科-医保