年底双薪可以按照年综合所得来计算个人所得税，即把年底的双薪和年度工资算入年综合所得，按照（年综合所得-起征线-专项附加扣除-社保扣除）*税率来计算应缴纳的个人所得税。
根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。
（三）经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。
（四）财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元；四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。
（五）财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。
（六）利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。
扩展资料：
年底双薪单独计税：
根据国家税务总局的最新规定，从现在起，个人取得的“双薪”，将单独作为一个月的工资、薪金所得计征个人所得税。
即第12个月的工资、薪金所得，将在扣除3500元起征点的费用后，对剩余部分按相应税率计算并缴纳个人所得税；第13个月的工资、薪金所得，将不扣除800元起征点费用，而是对其全额按相应税率计算并缴纳个人所得税；
如果纳税人第12个月的工资、薪金所得不足3500元，那么就可以将其第12个月和第13个月的工资、薪金所得加起来，再减去3500元后，对余额按相应税率计算个人所得税。
例如，每个月的工资为4000元。这4000元作为一个月扣缴个人所得税，由于其“五险一金”已经在12月份工资中扣除，所以不能在第13个月的工资中扣除任何费用，必须全额缴纳个人所得税，4000×10%-105=295元，而12月份的个人所得税是：(4000-3500)×3%-0=15，所以12月份总计必须缴纳个人所得税295+15=315元。