国税务三方协议在税务局验证不通过应该是在办理过程中，静心等待就好。
三方协议在办理过程中，需要从国税先取得相关协议，然后到开户银行办理相关的关联业务，在银行办理后再将其中一联送回国税。
如果到银行办理后，国税局验证不通过应该是在办理过程中，公司名称或者银行的开户账号、名称有出入，可以确认一下，核准后重新再办理就可以了。
办理银行税务三方协议的程序：
拿着开户许可证到税务局办纳税账户登记备案；
由税务局出具制式的三方协议，税务局先盖好章，企业盖章；
到开户银行拿三方协议请银行盖章，提醒要银行及时在系统同步开通，否则税务系统连不上，会影响交税。
银行留下一份协议，再交到税务大厅即可。
注：
三方协议号是指纳税人委托银行代扣税、费、基金的协议书编号，三方指的是纳税人、税务机关、银行，协议就是委托银行扣缴税款协议。流程是这样，首先纳税人需要先到税务机关（通常都是办税服务厅）取得纸质协议书（一式三联），然后到开户银行去办理即可。