1991年10月，杜达耶夫当选为车臣总统，并宣布车臣独立。然而，这一举动引发了冲突。1994年12月11日，联邦中央派遣军队平息了车臣的叛乱。1996年8月30日，俄安全会议秘书列别德与车臣武装力量参谋长马斯哈多夫签署声明，提出和平解决车臣危机的计划，目标是在2001年前确定车臣的地位问题，从而结束了第一次车臣战争。
然而，谈判并未带来实质成果。1997年1月，马斯哈多夫继续担任车臣共和国总统，但双方关系依然紧张。车臣当局加速了分裂进程，形成了事实上的国中之国。1999年，车臣极端伊斯兰势力渗入达吉斯坦，引发武装叛乱，试图建立独立的达吉斯坦伊斯兰共和国。联邦政府迅速采取行动，将他们驱逐出达吉斯坦，标志着冲突进一步升级。同年10月，第二次车臣战争全面爆发，俄军对车臣境内的分裂分子展开大规模攻势。
2000年2月，俄军攻克格罗兹尼，取得了关键胜利。6月，普京宣布实行总统直接治理，任命卡赞采夫为北高加索代表负责执行。车臣穆夫提和反对派领袖卡德罗夫在6月16日被任命为临时政府首脑，局势进一步明朗。2001年初，普京决定将清剿残匪的任务转交给联邦安全局，标志着车臣从战争状态逐渐转向和平轨道。同年2月，当局开始从车臣撤军，车臣政权开始转型，新政府的成立和常设行政机关的设立，如伊里亚索夫担任总理，标志着车臣开始进入正常运作阶段。
车臣是苏联解体进程中的一个重要环节，车臣是俄罗斯的政治黑洞，也是权力的祭坛。车臣，甚至也是外部势力削弱俄罗斯的阴谋，是大国争夺高加索的一个步骤。第一次车臣危机发生于1994—1996年，宣布“独立”的车臣总统杜达耶夫利用俄内部政治、经济、军事的混乱。车臣危机折射出了苏联解体以后俄罗斯国家的复杂的民族、社会状况；而俄罗斯军队在车臣的挫折，以及俄罗斯在车臣危机与战争中付出的代价，是苏联解体以来俄罗斯民族遭受的苦难的缩影。