明武宗南巡之所以遭到百官反对，是因为当时的文官们，普遍认为国务需要有皇帝主持，而南巡劳民伤财，并且早有人侦知——宁王阴谋叛乱，担心皇帝的安危。
当中国的皇帝，政事是十分繁忙的。每天全国各地呈上的奏折，按理说都需要御笔亲批。尽管事实上，最后都由司礼监秉笔太监包揽，但是表面上，“国不可一日无君”。因此当皇帝的，极少自由出巡。
明武宗时期，皇帝宠信太监刘瑾，许多国家大事，都由这个太监包揽。刘瑾伏诛之后，武宗又信任锦衣卫钱宁和江彬二人。而钱宁早在1514年，与宁王勾结，图谋不诡。文官担心皇帝南巡，落入宁王与钱宁的圈套，被里应外合“包饺子”。
另外，武宗生性贪玩儿，生活铺张。文官们认为他一旦南巡，还会造成地方上的百姓荒恐。
于是翰林院修撰舒芬，联合浙江多名官员，上书明示武宗：朝中有亲王，欲仿效汉代刘濞，制造“七国之乱”。
又有文臣们列举秦始皇出巡，于博浪沙遭袭，并死在南巡路上为例，极力劝阻明武宗出巡。
没想到武宗暴怒，并发明了“廷仗”。将一百多名文官当众责打。有一些体弱的老臣，竟因此直接被仗毙。
中国的文臣，一直颇受国家尊重。在古代，秀才见官可以不跪；禀生不事生产，国家还按月发钱发粮。而在宋代，官员上朝还可以落坐。但是自明朝正德以后，文官地位简直一落千丈。
事实上，明武宗执意南巡，是因为听了钱宁的对头，江彬的撺掇。江彬与钱宁在武宗面前争宠，他早就知道钱宁与宁王勾结，但是没有确凿证据。他希望通过让朱厚照涉险，来让宁王与钱宁暴露。一个是稀里糊涂的亲信，一个稀里糊涂的皇帝，结果搞出了“南巡之争”。
这件事发生在1519年的3月。到当年6月的时候，宁王当真就作乱了。只不过幸得佥都御使的王阳明，平息叛乱，活捉了宁王。
此时，明武宗又让王阳明隐瞒真相，自已再度找借口南下。让王阳明把宁王押到他面前，装成是自已捉获的。然后一路游山玩水，最后掉进湖水里淹死了。
因为明武宗南巡只是为了玩乐，还要耗费大量的人力、物力。明武宗原名朱厚照，是君王的嫡出皇子，自出生就是万人瞩目，受到万千的宠爱。而小时候的朱厚照也非常的聪明，开蒙读书之后，老师教导的东西只一遍就能完全掌握，因此很快被君王立为了太子。
不久君王驾崩，朱厚照继承了皇位，在继位初期朱厚照还是比较勤于政务的。不仅平定了国内的叛乱，还打败了蒙古军队，使边境的百姓免于收到蒙古的骚扰，而且还颁布了一系列的仁政，减轻税赋，鼓励百姓们耕种。可随着时间的推移，朱厚照却发生了性格上的变化，露出了本来面目，开始是几天不上一次朝，到后来是一个月，最后直接将朝政撒手不管了，每日只是饮酒作乐。
作为君王的朱厚照每日贪图享受，身边伺候的人为了讨他的欢心，更是想尽办法的阿谀奉承。朱厚照喜欢动物，身边的奴才便想尽办法搜罗各种珍稀动物送进宫，甚至在宫中建造了一个动物园，关满了各式各样的动物，以便朱厚照随时观赏。不仅如此，朱厚照觉得在宫中待腻了的时候，身边的人便偷偷的带朱厚照出宫去游玩。
后来变得越加放肆，竟然引诱朱厚照去江南游玩，还美名说是南巡体验民间百姓的疾苦，这一消息传出来后，立刻遭到了朝中大臣的反对。帝王出巡不仅要劳民伤财，而且还要万无一失，如果在途中发生危险怎么办，可是臣子的劝说却引起了朱厚照的反感，对劝说的大臣都动了刑后踏上了南巡之路。
众臣子之所以会反对明武宗去南巡，主要是因为明武宗受别人之意去江南“游玩”，所以说并不是真正的去南巡，这也要因为他身边的一位奸臣了，总会在明武宗的身边出一些计谋，而且最主要的是之前还救过明武宗的性命，所以两个人之间的关系并不一般，而且两人都特别爱游玩，所以他总是听着“奸臣”的话，将朝政扔在一边出去游玩。
在明武宗自己的内心中也慢慢认为，只要离开了朝中，就会觉得生活特别简单愉快，所以更是不想要回去了，而这个时候很多忠臣也已经慢慢察觉到了明武宗的想法，所以在他想要出去南巡的时候，大家就开始反对了，明武宗心里就犯了难，不知道一时间该怎么出去，而身边的“奸臣”也为他出谋划策，所以当一次有机会要出去征战的时候，他就下令说自己要亲自去。
实际上只是想要用这个机会到江南去游玩，而这样的想法也被身边的大臣看了出来，但是明武宗执意要南行，没有人可以拦得住，可身边的忠臣们却看不下去了，想办法阻挡明武宗南行，有些人就被囚禁起来，甚至有的人被“活活打死”，这也算是君主“杀鸡敬猴”的一种做法了，之后不让身边的人再提此事。
可是明武宗自己也没有想到的，征兵借口很快就被驳回了，也不需要再出征，因为该抓的人已经被抓了，本以为明武宗应该不会再次出行，可没想到的是什么都难以阻挡他想要下江南的心，但也就因为执意要去最后反而害了自己。