你说的原形指的是句子结构吧，即疑问句中助动词提前。
Could you tell me how many countries took part in the 2008 Olympic Games?
以你的这个句子为例，你可以看到主句could you tell me中，语序是倒装的，即could这个助动词在主语you的前面，这就是正常的疑问句的语序（你所说的原形）。
而在从句how many countries took part in the 2008 Olympic Games中，你可以看到，这句话中并没有把谓语中的助动词提到句子前面（如果有，应该是did）,可以说这不是个正常的疑问语序，也就是你所说的“不用原形”。 （当然，你的这个例子不太说明问题，因为该从句偏偏是对主语提问，无论如何，都不用倒装。）
精炼一点说，就是，你记住，在从句中用陈述语序，主句中该怎么用还怎么用。
再给你举个例子：
比较两个句子：
You can ask him where you can buy the tickets.（这句话是正确的。）
You can ask him where can you buy the tickets.（这句话就是错误的。）
呵呵，我的基础好不好自己心里有数，估计你用二十年时间也追不上。
您自个儿的问题说得不明不白的，怪谁呢？
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