方法一：经典方法，全站仪在已知坐标（含高程）点上设站；
方法二：后方交会，全站仪在任意点上设站；
方法三：对边测量，全站仪测两点高差。
方法一：经典方法：
先说方法一。说这个方法是经典方法，是因为：
1．其测量原理我们在学习经纬仪视距测量时就学习过，每种测量教材中都有；
2．测量教材中有关全站仪高程测量原理，都按此原理进行阐述；
3．全站仪高程测量的相关设置，都按此原理进行的。
我们从（1）式中可以发现，全站仪一旦设站完成，测站高程和仪器高度均为定值，若测量过程中不改变棱镜高度，则除了Ssina（即实测参数）外，等式右侧其它各参数之和均为恒等值，由此我们可以得出：
全站仪一旦设定，同时不再改变棱镜高度的话，全站仪对各点的测量高差，其实质是每个三角高差dZ的差值
这个结论我们先记住，它将是后面方法二和方法三的理论基础。
高程测量即测目标点与已知点间的高差，从而得出目标点的高程。一般常用的是用水准仪测量高差，精度相对较高，但在特殊环境下（两点间高差比较大或不宜用水准仪观测等）必须用全站仪来观测。
全站仪仪器内计算待测点高程的过程是：
全站仪控制点高程+全站仪高+全站仪发射点与棱镜中点高差-对中杆高度=对中杆控制点高程，
比如全站仪架的控制点高程为100m，仪器高1.5m，测得高差显示为8m（假设棱镜头比全站仪发射点高），棱镜高度1.3m，则待测点高程为100+1.5+8-1.3=108.2m
全站仪测量点高程可以满足一般施工，比水准仪方便，任意建站整平就可开始测量待测点和已知点相对高差，从而快速得出待测点高程。现在桥梁施工盖梁完，就要求接着做垫石，这时水准仪只能从桥头过来，如果距离比较远那就只能拿全站仪测。全站仪测高程开始时先正倒镜各测几个垫石，观察数据稳定时就可以直接用正镜测完。
全站仪测量高程，我拿宾得、徕卡的测过几座桥，从基础施工到铺装，150米内没问题，可以满足施工要求，相对用水准仪测的那几座桥真的很省力。不放心可以拿水准仪复核几个点就可以了。
有时候做控制点，用水准仪翻山越岭的测累计误差其实比全站仪大，也耗时耗力。
全站仪测量高程其实涉及到很多改正，比如温差、高程修正，可以翻阅其他参考书，去新浪爱问搜有很多，不过我们一般做一级导线点控制点距离也就400米以内偏多，不用改正可以满足施工精度了，高程四等水准的话也不用折光、温差改正，只要对向观测的两次高差满足规范（查<工程测量规范>GB50026-2007)，以及平差过关就可以了。
具体操作过程的话还是要根据不同仪器和不同测量方法而定，但原理都大同小异。
全站仪使用方法视频教程 全站仪使用 全站仪使用教学视频