在论文中标注参考文献是为了体现研究的深度和广度，同时也为了尊重他人的学术成果。以下是一些关于如何清晰、规范地标注参考文献的要点：
一、标注位置
论文题目、作者及单位、摘要、关键词、附录中一般不引用或标注参考文献。
层次标题、正文中可引用标注参考文献，一般直接标引在引文内容后，在右上角标注。
图表中一般不标注参考文献，必要时可将文献标准码标注在图表的注释或说明（即图注或表注）中。
二、标注方法
引文序号：在文中引用文献时，可以使用顺序编号的方式进行标注，例如“[1]”、“[2]”等，编号的顺序即为引用的顺序。引文序号通常以方括号括起来。
作者-年份制：一些学科领域使用作者-年份制进行标注，即在文中引用文献时，标注作者的姓氏和出版年份，常用的格式为“（作者姓氏，年份）”或“作者姓氏（年份）”。
三、标注格式
直引：
引文为完整句子时，如果是直接引用某人的观点，有原作者姓名、冒号、引号齐全的，则句子的最后一个标点点在引号内，参考文献标注码标注在引号外的右上角。
如果只是引用原文，前面不出现作者姓名和冒号，只出现了引号，参考文献标注码也标注在引号外的右上角，但这处引文的最后一个标点符号须点在参考文献标注码外的右下角。
意引：
对著作或引文的著者进行标注。在叙述引文内容（不包括直引的情况）时若写出文献著者名，则将标注码以角标形式标注在著者名的右上角；若写出著作名称，或同时写出著者名和著作名称，则均应将标注码标注在著作名称的右上角。
对引文中析出的数据、观点、结论等进行标注。若没有写出著作或引文著者名，只在文中引用参考文献中的有关数据或材料等，且引用的部分又不构成一个句子时，应直接把文献标注码标注在相应的词或词组的右上角。
四、具体操作（以Word为例）
打开要标注参考文献的Word文档，用鼠标点在需要添加标注的位置。
点开【引用】选项卡，点击【脚注和尾注】。
在弹出的设置框中，勾选【尾注】，格式选择【方括号样式】，应用更改设置为【整篇文档】，然后点击【插入】。
接下来只需要在【引用】选项卡下点击【插入尾注】即可加入其他参考文献标注。
请注意，以上只是一般的标注参考文献的方法和要求，具体的标注方式还需要根据学术领域和指导教授提供的具体要求进行编写。
参考文献书籍引用格式为：
作者.书籍名称[M].出版社所在城市:出版社名称,出版年份:页码.
如：郑刚.生物医学光学[M].南京:东南大学出版社,2017:383.
如果是合著，即有多名作者，其作者的书写格式与期刊多名作者的书写格式相同。
参考文献一般包括：专著[M]、论文集[C]、报纸文章[N]、期刊文章[J]、学位论文[D]、报告[R]、标准[S]、专利[P]、论文集中的析出文献[A]。
以上内容参考：全国标准信息公共服务平台-信息与文献 参考文献著录规则