一、定义不同
低收入证是指家庭成员人均收入和家庭财产状况符合当地人民政府规定的低收入标准的居民家庭的证书。
低保证是享受最低生活保障的困难人群身份证明，持有低保证的家庭可依法领取低保金并享受国家有关优惠政策。
二、标准不同
低收入证标准
1、按照上一年度城镇居民月人均可支配收入的比率设定。如广西壮族自治区，城市低收入家庭收入标准，按照统计部门公布的当地上年度城镇居民人月均可支配收入的40%~50%确定。
2、参照当地居民最低生活保障标准设定。如长沙市低收入家庭具体标准为当地、当年城乡居民最低生活保障标准的2倍。
3、按家庭比例确定，如《江苏省城市低收入家庭认定办法》规定，各地确定低收入家庭收入标准，原则上要覆盖20%以上的城市家庭。
4、多项指标综合考虑。如《河南省城市低收入家庭认定办法》规定，城市低收入家庭收入标准的确定应当根据当地经济和社会发展水平；
统筹考虑居民人均可支配收入、最低生活保障标准、最低工资标准以及住房保障和其他社会救助的关系，以满足城市居民基本生活需求为原则，按照不同救助项目需求和家庭支付能力确定。
低保证标准
申请农村低保待遇应同时具备下列条件：
1、持有本县农业居民户口。
2、居住在农村村组，家庭承包土地的农村居民。
3、共同生活的家庭成员人均年纯收入和实际生活水平低于当地农村低保标准（具体询问当地民政部门）。
三、申请材料不同
低收入证申请材料
1、书面申请报告；
2、身份证及复印件；
3、家庭成员收入证明；
4、婚姻状况证明；
5、家庭成员关系证明以及需要提供的其他材料。
6、居委会或者村委会出具的家庭真实收入证明。
低保证申请材料
1、书面申请书。
2、家庭成员的户口簿。
3、共同生活的家庭成员的合影。
4、土地、山林、水面承包合同或证明。
5、外出务工人员收入证明。
6、离异家庭涉及有赡、扶、抚养关系的应提供离婚证明。
7、非农户人员的家庭，应提供非农户口人员的收入证明。
8、对劳动能力有争议的，需提供有效健康证明。
9、残疾人提供残疾证。
10、审批管理机关要求提供的其他有关材料。
参考资料来源：百度百科-低收入家庭
参考资料来源：百度百科-低保证
参考资料来源：百度百科-低保