土壤是药用植物生长发育的场所和基础。土壤最基本的特性是具有肥力，因此，能源源不断地供给植物生长发育所需的水分、养分、空气等物质。而其影响药用植物生长的土壤物理性状，主要有下列因素：土壤是由固体、液体、气体三相物质组成的一种复杂的有机整体。其中固体部分是组成土壤的“骨架”。根据组成土壤的砾、沙粒和黏粒所占比例的不同，可将土壤分为沙土、黏土和壤土三种不同性质的土壤。土壤中含沙粒量达90%以上的称为沙土。
沙土质地疏松，通气透水性能良好，但保水保肥能力差，且土温变化剧烈，一般药用植物不宜栽培。简易鉴别方法：手触摸有粗糙感，用水漫湿后不能捏成团，一松即散。土壤中含黏粒量达60%～80%之间的称为黏土。黏土通气透水性能差，结构致密，易板结，一般药用植物也不宜栽培。简易鉴别方法：用水调和后，能搓成条，可弯曲成环状，加压无裂痕。土壤中含沙粒与黏粒介于以上两者之间的称为壤土。壤土通气、透水、保水、保肥、供水、供肥以及耕作性能均良好。尤其是沙质壤土，松而不散，紧而不板，湿而不黏，通气透水，具有保证供给药用植物正常生长发育所需的水、肥、气、热的能力，是最适宜栽培大多数药用植物的场所，尤其适宜于根及地下茎类中药材的栽培。简易鉴别方法：加适量水调和，可捏成团，不能搓成条。
土壤酸碱度是土壤的又一重要性质，通常用pH表示。其简易测定方法：先将土壤加适量清水溶解为土壤溶液，然后，取广泛石蕊试纸加以测定，观察染色情况，再与比色板对照：pH等于7的为中性，大于7的为碱性，小于7的为酸性。大多数药用植物喜在中性或微酸微碱性土壤中生长。亦有少数药用植物，如厚朴、栀子、肉桂、贝母等喜微酸性或酸性土壤；而枸杞、酸枣、甘草等则喜微碱性或碱性土壤。盐碱性大的土壤一般不适宜栽培药用植物。土层的厚薄与栽培药用植物的成功与否密切相关。
深根性的药用植物，如人参、甘草、山药、丹皮、黄芪、丹参等要求土层深厚，其根系发育良好，药材质量好，产量高。重黏土其土质黏重，结构致密，耕作困难，同时缺乏有效养分，必须进行改良以后，才能栽培药用植物。改良措施主要是进行深耕细作；增施有机肥；种植绿肥或施用石灰；掺沙质土改变其组成。