超梦/梦幻/古拉顿/海皇牙/裂空座等是爬7秘宝迷宫，打败后有50%几率加入
蘑菇马桶迪亚鲁加帕路基亚是第二次进入其所在迷宫即可100%加入
还有一部分神兽是携带神秘零件/石板后在普通迷宫中出现
全神兽捕捉方法：
144 フリーザー Articuno 急冻鸟
なだれやま Mt.Avalanche 雪崩之山
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
145 サンダー Zapdos 闪电鸟
エレキへいげん7F Amp Plains7F 电力平原7F
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
146 Moltres ファイヤー 火焰鸟
きょだいかざん10F Giant Volcano10F 巨大火山10F
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
150 ミュウツー Mewtwo 超梦
てんくうのかいだん Sky Stairway 天空阶梯
持有シークレットランク,てんくうのかいだん出现,在咖啡厅接受挑战状|接受挑战并打倒后100%加入
151 ミュウ Mew 梦幻
ミステリージャングル Mystery Jungle 神秘丛林
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
243 ライコウ Raikou 雷皇
なんとうしょとう 东南群岛
持有シークレットランク,なんとうしょとう出现,在咖啡厅接受挑战状|接受挑战并打倒后100%加入
244 エンテイ Entei 炎帝
れっかのどうくつ 烈火洞窟
持有シークレットランク,れっかのどうくつ出现,在咖啡厅接受挑战状|接受挑战并打倒后100%加入
245 スイクン Suicune 水君
まのかいいき 中间海域
持有シークレットランク,まのかいいき出现,在咖啡厅接受挑战状|接受挑战并打倒后100%加入
249 ルギア Lugia 路基亚
とざされたうみ18F Surrounded Sea18F 封闭之海18F
持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
250 ホウオウ Ho-oh 凤凰
かぜのれいほう19F Mt.Mistral19F 风之灵峰19F
持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
251 セレビィ Celebi 雪拉比
しんぴのもり10F Mystifying Forest10F 唯美森林
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
377 レジロック Regirock 岩圣柱
ばんにんのどうくつ Aegis Cave 看守洞窟
击败レジギガス后|再战打倒后几率加入,固定型
378 Regice レジアイス 冰圣柱
ばんにんのどうくつ Aegis Cave 看守洞窟
击败レジギガス后|再战打倒后几率加入,固定型
379 Registeel レジスチル 钢圣柱
ばんにんのどうくつ Aegis Cave 看守洞窟
击败レジギガス后|再战打倒后几率加入,固定型
380 ラティアス Latias 红水都
そらのさけめ10F/しあわせみさき19F Spacial Rift10F/Happy Outlook19F 天空裂缝10F/幸福山峡19F
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
381 Latios ラティオス 蓝水都
そらのさけめ二段5F/あんやのもり24F Spacial Rift二段5F/Midnight Forest24F 天空裂缝二段5F/暗夜森林24F
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
382 カイオーガ Kyogre 海皇牙
そこなしのうみ Bottomless Sea 无底深海
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
383 グラードン Groudon 古拉顿
かげろうのさばく Shimmer Desert 干旱沙漠
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
384 レックウザ Rayquaza 天空龙
てんくうのかいだん Sky Stairway 天空阶梯
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
385 ジラーチ Jirachi 许愿星
ほしのどうくつ 星之洞窟
特别剧情1完成,持有シークレットランク,在咖啡厅接受挑战状|接受挑战并打倒后100%加入
386 デオキシス Deoxys 迪奥西斯
かがやきのおか17F Shimmer Hill17F 光辉之丘17F
持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
480 ユクシー Uxie 黄圣菇
ねっすいのどうくつ Steam Cave 热水洞窟
通关后|最深处战斗后100%加入,固定型
481 エムリット Mesprit 红圣菇
りゅうさのどうくつ Quicksand Cave 流沙洞窟
通关后|最深处战斗后100%加入,固定型
482 アグノム Azelf 蓝圣菇
だいすいいしょうのみち Crystal Crossing 水晶之路
通关后|最深处战斗后100%加入,固定型
483 ディアルガ Dialga 钻石兽
じげんのとう 次元之道
通关后|最深处战斗后100%加入,固定型
484 パルキア Palkia 珍珠兽
そらのさけめ Spacial Rift 天空裂缝
噩梦神剧情结束后|最深处战斗后100%加入,固定型
485 ヒードラン Heatran 火钢兽
きょだいかざん Giant Volcano 巨大火山
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
486 レジギガス Regigigas 圣柱王
ばんにんのどうくつ Aegis Cave 看守洞窟
击败レジギガス后|再战后100%加入,固定型
487 ギラティナ Giratina 鬼龙
せかいのおおあな World Abyss 世界大穴
持有シークレットランク,在咖啡厅接受特别依赖|打倒后几率加入
488 クレセリア Cresselia 梦兽
サメハダいわ
噩梦神剧情结束后|在サメハダ对话后加入,固定型
489 フィオネ Phione 菲奥奈
きせきのうみ Miracle Sea 奇迹之海
击败暴鲤龙后|第二次到达后100%加入,固定型
490 マナフィ Manaphy 玛娜菲
サメハダいわ
噩梦神剧情结束后|海岸边对话后加入
491 ダークライ Darkrai 噩梦兽
きせきのうみ3F/そらのさけめ14F/しんぴのもり13F/クレバスのどうくつ二段2F
Miracle Sea3F/Spacial Rift14F/Mystifying Forest13F/Mystery Jungle二段2F
奇迹之海3F/天空裂缝14F/唯美森林13F/神秘丛林二段2F
うみのリゾート出现后,持有ひみつのせきばん或なぞのパーツ|徘徊型,打倒后几率加入
492 シェイミ Shaymin 雪米
そらのいただき 天空之顶
そらのいただき完成后|二次到达山顶后100%加入,固定型
追问我用的中文版，用中文就可以了。
追答急冻鸟在雪崩之山。在咖啡厅接受特别任务后会得到新地图-雪崩之山，在顶层打倒它后有50%的几率加入
闪电鸟在电器平原，持有神秘齿轮/秘密石板后会在7F出现,打倒后有几率加入。
火焰鸟在巨大火山，持有持有神秘齿轮/秘密石板后会在10F出现,打倒后有几率加入。
超梦在天空阶梯，等级会随着挑战任务层数的增加而增加，战斗胜利后超梦100%加入（这个的等级我不是特别清楚，不过我接到的是40F的任务，超梦加入的时候是80级）
梦幻在神秘丛林，入手方法以及几率同急冻鸟（7秘宝迷宫的神兽入手方法均是接受任务后爬迷宫，顶层打败后50%几率加入）
雷皇在东南群岛，需要在咖啡厅左下角那里接受它的挑战任务，击败后100%加入。
炎帝在烈火洞窟，入手方法同雷皇。
水君在魔鬼海域，入手方法同雷皇。
路基亚在封闭之海，持有神秘齿轮/秘密石板后会在18F出现,打倒后有几率加入
凤凰在风之灵峰，持有神秘齿轮/秘密石板后会在19F出现,打倒后有几率加入
雪拉比在神秘森林，持有神秘齿轮/秘密石板后会在10F出现，打倒后有几率加入
三马桶/马桶王在看守洞窟，依旧需要收集字母石头然后打败= =+，打倒后100%加入
红水都在幸福山谷，持有神秘齿轮/秘密石板后在19F出现
蓝水都在暗夜森林，持有神秘齿轮/秘密石板后在24F出现
海皇牙在无底深海，入手方式同急冻鸟
古拉顿在炎阳沙漠，入手方式同急冻鸟
天空龙在 天空阶梯，入手方法同急冻鸟
许愿星在星之洞窟，需要完成特殊剧情1龅牙狸的心愿，然后在咖啡厅接受挑战任务，打倒后100%加入
迪奥西斯在光辉之丘，持有神秘齿轮/秘密石板后在17F出现
黄圣菇通关后去热水洞窟，顶层战斗胜利后100%加入
红圣菇在流沙洞窟，入手方式同黄圣姑
蓝圣菇在水晶通路，入手方式同黄圣菇
钻石兽在时限之塔，打倒它后100%加入
珍珠兽在空间裂缝，条件为二周目噩梦神剧情结束，打倒后100%加入
火钢兽在巨大火山，入手方式同急冻鸟
鬼龙在世界大穴，入手方式同急冻鸟
梦兽在噩梦神剧情结束后和它对话后加入
菲奥奈在奇迹之海击败暴鲤龙，第二次到达后100%加入
玛娜菲在噩梦神剧情结束后海岸边对话后加入
噩梦兽在奇迹之海3F/空间裂缝14F/神秘森林13F/神秘丛林二段2F，打倒后小几率加入（噩梦神是除了变隐龙以外最难入手的PM，必须要满级队长带着黄金假面几率才会提高）
雪米在第二次爬天空之顶顶层后加入
变隐龙：满级队长携带黄金假面，拥有智慧技能“社交化”后抢劫他地摊，击败后有及其特别微小的几率加入
参考资料：绝对原创，望能帮到你
参考资料：原创，希望能帮到你