《进击的巨人》中艾伦父亲的地下室的秘密是揭秘关于巨人所有谜团的一个希望之地。
艾伦父亲格里沙是创造巨人的创始人之一。格里沙耶格尔最初来自于大陆的，他自小在集中营里长大，格里沙的妹妹被扔去喂狗。艾伦的爸爸自此誓要重建艾尔迪亚帝国。格里沙加入了「艾尔迪亚复权派」，该党派后来就是研究出了巨人药剂，目的就是为了重建艾尔迪亚帝国。
地下室中，满是研究巨人的书籍，这是漫画揭示的内容。而巨人的真相隐藏在格里沙书桌上抽屉里的暗格，艾伦的钥匙也正是打开这个抽屉的，抽屉中有三本书，书中记载着格里沙在墙外的一切，墙外的敌对国家叫马莱和进击的巨人为夺取始祖巨人之力来到墙内等。
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艾伦父亲全名为格里沙·耶格尔，是一名医生，不过更为重要的是他身为帕拉蒂岛墙外人类，曾加入艾尔迪亚复权派，反抗马莱政府，知晓巨人的所有秘密，并将所有的一切关锁在自己的地下室中，唯一的线索就是交托艾伦的钥匙。
进击的巨人第一季第一季，在巨人突破城墙进攻了艾伦的家乡。艾伦的父亲在交出地下室钥匙的时候，同时把进击的巨人力量传给了艾伦。得到巨人力量的艾伦知道父亲是对巨人有一定的了解，而且父亲不会无缘无故托付一条钥匙，所以艾伦深信地下室内含有巨人的秘密。
参考资料：百度百科-艾伦的父亲格里沙·耶格尔
艾伦的父亲的地下室一直是《进击的巨人》中最神秘的地方了。
艾伦的父亲格里沙·耶格尔最初就是来自于大陆的。留在大陆的艾尔迪亚子民处在水深火热之中，他们在集中营内被马莱族任意的屠杀玩弄。格里沙就是在集中营里长大，格里沙的妹妹被扔去喂狗。艾伦的爸爸自此誓要重建艾尔迪亚帝国。格里沙加入了「艾尔迪亚复权派」，并娶妻生子。他们的儿子吉克正是在第二季中出现的会说话的猿巨人，也就是艾伦同父异母的哥哥，并且格里沙的妻子还是王室的人。
后来，马莱人挑选艾尔迪亚小孩继承七大巨人之力，吉克被选中。因为从小被奴化教育的原因吧，7岁的吉克出卖了他的父母，这也是悲哀吧。我们现在已知的情报是，岛上的国王是不喜欢战争，希望和平的，但是马莱人却宣称接到了岛上人的挑战书，这明显是阴谋。
原来，马莱人想要到岛上夺取始祖巨人之力，并要获取岛上丰富的燃料资源。大陆上的文明已经相当发达了，应该是接近二战时期的水平了吧，飞机、大炮、装甲车都有。而且大炮威力很大，海军舰队齐射之后可以将铠之巨人基本干掉。
被出卖了的艾尔迪亚人经过了痛苦的审判后被送到了乐园接受惩罚，也就是变成巨人。然而，一同来执行审判的人中有格鲁吉，他就是潜伏在马莱人中的艾尔迪亚人，并且拥有进击的巨人之力。进击的巨人，就是追求自由的意思，也是漫画的名字。变身后，干掉了所有来的马莱人。?
本回答被提问者采纳藏着变成人类的书和药水，之所以要藏起来是怕艾去偷喝然后在人类世界捣乱。
《进击的巨人》（进撃の巨人），是日本漫画家谏山创创作的少年漫画作品，于2009年在讲谈社旗下的漫画杂志《别册少年Magazine》上开始连载。
该作品曾获2011年“这本漫画真厉害！”男性榜第1名、“讲谈社漫画赏少年部门赏”等奖项 。2012年12月正式宣布TV动画化，2013年4月6日，由WIT STUDIO改编的同名电视动画正式开始放送。
截止至2017年3月，单行本21卷累计发行量突破6300万册。卷均300万册。
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故事内容
107年前（743年），世界上突然出现了人类的天敌“巨人”。面临着生存危机而残存下来的人类逃到了一个地方，盖起了三重巨大的城墙。人们在这隔绝的环境里享受了一百多年的和平，直到艾伦·耶格尔十岁那年，60米高的“超大型巨人”突然出现。
以压倒性的力量破坏城门，其后瞬间消失，凶残的巨人们成群的冲进墙内捕食人类。艾伦亲眼看着人们以及自己的母亲被巨人吞食，怀着对巨人无法形容的憎恨和痛恨，誓言杀死所有巨人。城墙崩坏的两年后，艾伦加入104期训练兵团学习和巨人战斗的技术。
在训练兵团的三年，艾伦在同期训练兵里有着其他人无法比拟的强悍精神力。即使亲眼见过地狱也依然勇敢地向巨人挑战的艾伦，如愿以偿加入了向往已久的调查兵团。在他正做着到墙壁的外面去这个梦的时候，毁坏墙壁的超大巨人出现了。
参考资料:百度百科-进击的巨人
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