各有优劣吧，m6二代的像素密度高很多，明显超过同类产品，但传感器尺寸稍小一点（m6二代和a6400都是aps-c画幅的，不过佳能的aps-c画幅标准比其他几家还略小一点），所以当拍摄条件非常好时，可以有更好的画质表现，但如果环境不好的话，可能会更差。而且m6系列是没有evf的，想用取景器，需要单独购买，挂载到热靴口上，当然这样用闪光灯又是个问题了，总之就是拓展性不太好。另外，佳能m系微单的专用镜头比较少，甚至副厂都不多，经常需要转接单反镜头。
a6400则相对毕竟中规中矩一些，2000w级别的像素，是这个规格相机中的常见水平，带有evf这点比m6好，不过操控设计是索尼的短板，加上机身空间有限，所以操控上差一些。镜头方面，索尼相对就比较丰富了，原厂专用镜头稍差，但是可以用全画幅原厂镜头（除了价格，其他方面都还可以），嫌贵的话，还可以考虑副厂镜头。总之，这方面优势比较明显。
个人建议，除非是拿来给佳能单反系统充当备机，否则就应该先考虑a6400
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