原则上没有区别，民办大学、公立大学都属于我国国民教育全日制序列，都是经过教育部批准,具有统招资格,有权颁发国家承认本专科学历学位。这类学校的毕业证是国家承认，学信网可以查的；在考研条件中，没有民办大学、公立大学区分。
但本科作为第一学历，毕竟代表了学生在本科阶段学习经历，公办大学尤其是国家重点大学代表了学生较高学术水平，在考研自然受所考院校亲睐，这一点也无可厚非，有些大学研究生院在招生简章中注明，欢迎211、985院校考生报考本专业，也是对考生了学生在本科阶段高学术水平的肯定。而民办大学在我国主要培养实用技能型高级人才的。