1、南京财经大学（Nanjing University Of Finance & Economics）是一所以经济管理类学科为主，经济学、管理学、法学、工学、文学、理学等多学科支撑配套、协调发展的江苏省属重点建设大学，入选全国粮食行业（南京）教育培训基地、江苏省省级博士立项建设单位。
2、南京农业大学坐落于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学；位列世界一流学科建设高校、211工程、985工程优势学科创新平台，入选高等学校创新能力提升计划、高等学校学科创新引智计划、卓越农林人才教育培养计划；
国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部教育援外基地、国家大学生文化素质教育基地、国家理科基础科学研究和教学人才培养基地，是“双一流”农科联盟、高水平行业特色大学优质资源共享联盟、CDIO工程教育联盟成员单位。
3、南京林业大学简称“南林”，位于江苏南京，是一所由国家林业和草原局和江苏省人民政府共建、教育部与江苏省人民政府共建的省属重点大学，是国家首批世界一流学科建设高校，入选国家首批“卓越农林人才教育培养计划”、国家“特色重点学科项目”建设高校；
“国家建设高水平大学公派研究生项目”、“国家大学生文化素质教育基地”、“国家级大学生创新创业训练计划”、江苏省“2011协同创新中心”、江苏省“卓越工程师教育培养计划”，为江苏省十五所重点建设大学成员，是以林科为特色，以资源、生态和环境类学科为优势的多科性大学。
4、南京体育学院，简称“南体”，位于江苏省南京市，是一所为社会培养各类应用型体育专门人才的省属体育类本科院校。2017年，学校成为江苏省省级博士立项建设单位。
学校的前身是始建于1956年的南京体育学校，1958年与江苏省体育干部训练班和江苏师范学院体育专修科合并，成立南京体育学院。
5、江苏第二师范学院，简称江苏二师，坐落于江苏省南京市，是一所江苏省省属普通本科师范院校，入选教育部“卓越教师培养计划”、新工科研究与实践项目；
是国家级中小学骨干教师培训基地、中小学骨干校长培训基地、教育部中小学校长领航班培训基地和教师教育改革实验基地、江苏省决策咨询研究基地、江苏教育强省建设研究基地。
参考资料：
专业老师在线权威答疑 zy.offercoming.com南京作为江苏省的省会，包括本科院校和专科院校在内共有53所，大学还是比较多的。
南京市的本科院校
1.南京大学：无论是在南京市，还是江苏省，乃至全国，南京大学都是一所实力非常强的高校。南京大学创办于1902年，前身是三江师范学堂，历经多次变迁，1949年，“国立中央大学”易名“国立南京大学”，翌年径称“南京大学”。南京大学以“加强应用、注重基础、发展边缘、促进联合”为方针，以“基础研究面向国际学术前沿，应用研究面向国家战略需求和国民经济建设主战场、致力于解决关系国计民生的重大理论和现实问题”为指导思想，调整科研布局、加强科研组织，全力推进科学研究工作，把南京大学建成我国重要的科学研究中心。2016年2月，南京大学在2016国内高校保研率排名中排第六。2016年2月，中国一流大学百强榜出炉，南京大学排名第七。
2.东南大学：一所仅次于南京大学的高校，是中央直管、教育部直属的副部级全国重点大学，著名的建筑3.南京理工大学，是一所隶属于工业和信息化部的全国重点大学，素有“兵器技术人才摇篮”的美誉，1953年，学校由中国人民解放军军事工程学院（简称“哈军工”）分建而成，先后经历炮兵工程学院、华东工程学院、华东工学院几个发展阶段，1993年更为现名。1995年成为首批“211工程”重点建设高校，2011年获批建设“985工程优势学科创新平台”，是我国111计划”、“卓越计划”、“中俄工科大学联盟”的重要成员。学校拥有教职工3000余人，其中专任教学科研人员1800余人，博士生导师407名。南京理工大学秉承哈军工的优良传统，现已建成一所以工为主、多学科协调发展的高等学府。
老八校及原四大工学院之一，国家“211工程”、“985工程”首批重点建设的大学，是“卓越工程师教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”、“2011计划”、“111计划”入选高校，“卓越大学联盟”、“中俄工科大学联盟”、“中欧工程教育平台”主要成员。 截至2016年3月，东南大学占地面积5888亩，建有四牌楼、九龙湖、丁家桥等校区；设有29个院（系），拥有75个本科专业；有全日制在校生30000余人，其中研究生14440余人，在校留学生人数达到1813人，已发展为一所以工科为主，理学、工学、医学、文学、法学、哲学、教育学、经济学、管理学等多学科协调发展的综合性研究型大学。
当然。南京还有很多本科院校，在这里就不一一列举了，自己都可以查得到。
南京市的专科院校
1.南京工业职业技术学院，创办于1918年，中国教育史上第一所以“职业”两字冠名的职业教育学校。在近一个世纪的历史中，学校先后为国家培养了近十万名各类建设和管理人才。学校毗邻著名的南京钟山风景区，有仙林、中山、天堂三个校区，占地面积1360余亩，建筑面积近40万平方米，在校生13000余人。2014年学院官网显示，该院设有机械工程学院、能源与电气工程学院、经济管理学院、计算机与软件学院、艺术设计学院、文理学院、继续教育学院、国际教育学院、社会科学部、体育部8院2部。
2.南京交通职业技术学院，是经江苏省人民政府批准建立的全日制普通高等学校，隶属于江苏省交通运输厅。学院前身是创建于1953年的江苏省交通干部职工学校，1964年定名为南京交通学校。2001年6月经江苏省人民政府批准独立升格为南京交通职业技术学院。学院先后于2005年、2011年高水平通过教育部高职高专院校人才培养工作评估，是江苏省示范性高等职业院校，江苏省高技能人才培养示范基地，江苏省高等教育综合改革试验区建设试点院校。2012年经省教育厅批准，学院与南京林业大学联合举办“3+2”高职本科分段培养项目，培养本科层次的高端技能型人才。
南京大学、东南大学、河海大学、南京理工大学、南京航空航天大学、南京师范大学、南京财经大学、南京邮电大学、南京审计大学、南京工业大学、中国药科大学、南京农业大学、南京工程学院、南京信息工程大学、南京林业大学、南京中医药大学、南京医科大学、南京铁道职业技术学院、南京艺术学院、南京大学金陵学院、中国人民解放军陆军工程大学、东南大学成贤学院、南京航空航天大学金城学院。
南京共计51所大学，其中本科学校34所，专科学校17所，有南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京农业大学、南京医科大学、南京中医药大学、中国药科大学、南京师范大学、南京财经大学、江苏警官学院、南京体育学院、南京艺术学院等。