这个，完全不一样。
商务部是国务院组成部门，是原来的“对内贸易部”和“对外贸易部”在中国加入WTO后合并的。商务部是人大授权的，商务部是行业管理部门，负责国内商业行为的规范，制定商业规章制度，制定对外进出口政策，加强进出口贸易。
工商管理总局是国务院直属部门，是国务院授权的，负责国内工商业企业的登记、记录、规范、监督工作。工商总局没有权利制定任何规章制度，只能依据现有法规办事。负责企业（公司）、个体工商户的注册、监督、管理，这是面向所有工业和商业的，并不是管理商业部门。
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