大量的科学实验和临床实践证明，干细胞可通过两种机制，实现受损细胞的修复。
一是细胞替代作用，即注射进入人体的干细胞能自动地识别并移行至细胞损伤部位，然后分裂生殖成新的细胞。
二是可分泌许多细胞因子，促进受损或病变的细胞自身的修复，恢复细胞功能，从细胞层面达到疾病目的。
目前干细胞技术治疗的主要疾病：(1)帕金森病；(2)脑梗塞、脑出血、脑外伤、脊髓损伤后的截瘫；(3)肌萎缩侧索硬化症、脊髓性肌萎缩、多发性硬化；(4)老年痴呆症、脑萎缩、共济失调；(5)长期昏迷、植物生存状态；(6)脑瘫、小儿缺血缺氧性脑病、脑发育不全、智力低下；(7)脊髓炎后遗症等神经系统疾病；(8)糖尿病，糖尿病足；(9)股骨头坏死；(10)视神经发育不全，视神经萎缩等等；(11)恶性肿瘤；(12)自身免疫性疾病：类风湿，硬皮病，强直性脊柱炎，白塞氏病，系统性红斑狼疮等；(13) 骨质疏松；(14)肝硬化。
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