答案引自 知乎，答主：芒果汤圆
链接：
https://www.zhihu.com/question/39180685/answer/80206722第三季结尾福尔摩斯上飞机，飞了五分钟，之间他嗑药，然后他哥哥打电话叫他回来，说he is back，这时候他就开始思考为什么莫里亚提没有死，明明在我眼前自杀了，为什么还能回来，然后因为嗑药的关系，陷入了思考，也就是维多利亚时代，在他脑中的记忆库里，那时候发生的那个案件和莫里亚提有一个相同点，明明都是当着大家的面吞枪自杀，为什么都能复活？虽然推理过程和最后的结论不一定是当时的真相，但是暗示那就是福尔摩斯推理出来莫里亚提能死而复生的手段，也就是假装开枪，然后用别人的尸体代替自己。
新娘的案件是原来是假自杀，找了一个假的尸体先掩人耳目，因为验尸官是自己人，所以没问题，杀了丈夫以后，自己让同伙杀了自己，验明正身，后面一系列的新娘都是假的，这其实暗示福尔摩斯第一轮醒来的猜测，莫里亚提诈死，这里插一句，我认为他第一轮醒来，也就是挖坟那次，其实应该是梦中梦，嗑药太深了，挖坟其实是对自己猜测的验证，虽然在新娘案说得通，但是毕竟莫里亚提死在自己面前，他潜意识还是不相信的，去挖新娘的坟墓，如果真的有替死鬼，应该挖出两具尸体，但是只有一具，这表示福尔摩斯自身否定了莫里亚提没死的这个推论。
最后真的醒过来，说自己知道了，真相其实就是莫里亚提虽然死了，但是他是计划死亡，后面的事情早就安排好了，虽然他死了，但是莫里亚提体系还在按照他的意愿运作下来。
PS：我觉得这位答主说得很详尽了，链接里还有其他人的理解