整体来说，喝酸奶比喝牛奶好。首先酸奶包含牛奶几乎所有的营养，而且经过发酵之后营养会更加丰富，酸奶发酵之后牛奶中的乳糖被大量分解，减少发生乳糖不耐的可能性，如果是益生菌酸奶的话，其中的益生菌还会有更好的功效。
不过喝酸奶时候需要注意的一些问题：
1、市面上不是所有低温酸奶都是益生菌酸奶，购买时候请注意观察配料表，一般要包含有至少一种益生菌（嗜酸乳杆菌、乳双歧杆菌或者其他被证明是益生菌的菌种）的才能算作益生菌酸奶。
2、益生菌是不可繁殖的，基本上都依赖进口，所以国际上常见的益生菌酸奶是先进行发酵后再加入益生菌群，也就是说就算你用益生菌酸奶做引子也只能发酵出普通的酸奶
3、酸奶从生产到储运最后到喝到你肚子里之前的过程必须全程处于4摄氏度左右的环境中，脱冷时间不得超过2小时，否则你多花了钱也就是买到了一瓶普通的酸奶而已（益生菌死光光）。
酸奶好。牛奶和酸奶的蛋白质、脂肪及维生素等营养成分相差不大，二者可以相互替代。
二者区别是：
酸牛奶的蛋白质和脂肪更易被人体吸收，钙、磷、铁等的利用率也大大提高。酸奶中的乳酸菌产生乳酸等有机酸，这些有机酸有效地降低了肠道的酸碱度，从而可以有效地抑制肠道内有害病菌的繁殖。
酸奶可使肠道内的有益细菌增加，维持肠道菌群的平衡。酸奶还可以促进唾液和胃液的分泌，增进食欲，增强肠胃消化功能，治疗青少年便秘、消化不良等症。
提示：酸奶不能加热喝，而牛奶可以加热喝，对一些胃怕凉的人来说喝鲜奶比较合适。酸奶的含糖量高一些，不太适合胖人和正在减肥的人喝。婴儿肠胃发育不健全，也不适合喝酸奶，最好喝牛奶。
营养上没有区别。其实，我们喝奶制品，最主要的是想要获得奶制品里的优质蛋白质和钙。那么，无论是喝酸牛奶，还是喝纯牛奶，在这两点上都是没有什么区别的。
从钙等营养元素来源来讲：很多人都认为牛奶经过发酵变成酸奶后会更有营养，但事实上酸奶和牛奶的差异不是很大，都是钙的最佳来源，同样也都是蛋白质、维生素A、B族维生素和维生素D的好来源。
从消化和吸收角度来讲：牛奶中所含的糖分大部分是乳糖，有些孩子的消化液中缺乏乳糖酶，影响了对乳糖的消化、吸收和利用，很容易造成喝牛奶后胃部不适甚至腹泻，就是我们常说的"乳糖不耐受"。
而对于酸奶来说，其中的乳糖有大约1/3都被乳酸菌分解了。另外，乳酸菌在发酵的过程中还会产生一些乳糖酶，所以有乳糖不耐受的孩子可以安心地食用酸奶。