肛瘘的最佳治疗方法是选择手术，肛瘘属于一种慢性感染性疾病，多继发于肛周脓肿。有一些肠道的慢性炎症性疾病，比如
克隆氏病也容易导致肛门口多发的
瘘管形成。另外就是手术，尤其是肛周脓肿的手术以后，局部遗留的瘘管形成，病人也会有明显的肛门潮湿、疼痛、瘙痒、有脓血性的分泌物、有明显的瘘口，挤压有脓血流出。对于表浅性的肛瘘，可以在局部麻醉下进行切除，复杂性的肛瘘应该在
硬膜外麻醉下进行切开，内口也需要探查。对于高位的肛瘘，还需要选择挂线疗法，并且在手术以后需要静脉抗感染治疗，定期换药。
肛瘘占肛肠病的发病率，国内统计为1.67%～2.6%，国外为8%～20%。发病年龄以20～40岁青壮年为主。婴幼儿发病者亦不少见，主要见于男孩，女孩少见，男女孩比例为5：1。
病因：
1.肛周脓
肛周脓肿自行溃破或切开引流后造成。
2.直肠肛门损伤
外伤、吞咽骨头、金属，肛门体温计，肛门镜检查等损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起。
3.肛门裂反复感染
肛门裂反复感染可并发皮下瘘。
4.会阴部手术
内痔注射误入肌层或手术后感染，产后会阴缝合后感染，
前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘。
5.结核
既往报道
结核病并发结核性肛瘘者甚多。高达26．9%，近年来明显下降为4%～10%。主要为吞咽
结核菌引起，少数也可血行感染引起。
6.溃疡性大肠炎
7.克罗恩病伴发
克罗恩病伴发肛瘘者高达14%～76%。
8.直肠肛管癌
直肠肛管癌波及深部并发肛瘘。
9.血行感染
糖尿病、白血病、再生障碍性贫血等病，因机体抵抗力降低，常由血行感染引起肛瘘。
10.其他
淋巴肉芽肿，放射菌病，尾骶
骨髓炎，直肠、乙状结肠憩室炎等也可引起肛门直肠脓肿及瘘。
临床表现
流脓是主要症状，脓液多少与瘘管长短，多少有关，新生瘘管流脓较多，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，当外口阻塞或假性愈合，瘘管内脓液积存，局部肿胀疼痛，甚至
发热，以后封闭的瘘口破溃，症状方始消失。由于引流不畅，脓肿反复发作，也可溃破出现多个外口。较大较高位的肛瘘，常有粪便或气体从外口排出。检查时外口常为一乳头状突起或是
肉芽组织的隆起，挤压有少量脓液排出，多为单一外口，在肛门附近。也有多个外口，外口之间皮下瘘管相通，皮肤发硬并萎缩。也有多个外口位于两侧，瘘管成“马蹄形”，直肠指诊在病变区可触及硬结或条索状物，有触痛，随索状物向上探索，有时可扪及内口。若外口不整齐，不隆起，有潜行边缘，肉芽灰白色或有干酪样稀薄分泌物，应怀疑为结核性肛瘘。
肛瘘内口是原发病灶部位，定位不清必然造成治疗上失败，因为切除或切开内口是治愈肛瘘的关键。寻找和确定的肛瘘内口的方法有：
（一）肛镜检查 直视下看到齿线全部，内口常在红肿发炎的肛瘘，有分泌物，对可疑的肛隐窝可用银质园头探针探入。
（二）探针检查 先于肛门内插入手指，用银质园头探针，由外口沿管道向肠腔方向轻轻探入，完全性肛瘘，肠腔内手指在齿线附近可摸到探针确定内口，探时切忌盲目用力，免成假道，使感染扩散。
（三）染色检查 将干纱布放入直肠内，将美兰1～2ml由外口徐徐注入，然后拉出纱布，如有染色，即证明有内口存在。
（四）手术检查 切开瘘道，沿瘘道寻找内口，一般容易找到。
分类
肛瘘是复杂的，需要对它们进一步细分。国内外从多个角度给出很多分类方案。这里介绍目前临床最常用的分类方法。
1.高位低位
1934年英国S.mark医院的Millgan和Morgan用齿线作为
分界线。这种分法简单明了，实用性很强。齿线是肛门与直肠的分界线，可以在肛门镜下清晰可见。齿线处的肛窦是肛瘘的感染内口，以此线为起点，向上就是高位肛瘘，向下就是低位肛瘘。
1975年国内肛肠界在河北省
衡水市召开了我国历史上的第一次全国肛肠会议，在这次会议上确定肛门外
括约肌的深部是高低位的分界线。
2.单瘘多瘘
数外口或数瘘管，如果就只有一个，称为单纯性肛瘘，如果是多个，就叫复杂性肛瘘。但有些瘘管过长，或弯曲，临床也可以称为复杂性肛瘘。复杂性肛瘘有时是单内口，有是是多内口，这要分清，因为临床的治疗方法不同。这一分类方法是1975年我国学者在衡水肛肠会议上提出的，目前在临床上被广泛采用。
3.皮下黏膜下
大部分的肛瘘都穿越了肛门括约肌，但皮下黏膜下肛瘘是个例外。这是两类最表浅的肛瘘，基本都位于括约肌的内侧。位于肛缘皮下的叫皮下瘘，肛缘一周都可能发病。离肛缘都很近，一般不超过5cm，内口位于与外口对应的齿线处。位于直肠黏膜下的叫黏膜下肛瘘，内口位于同点位齿线。